D 2005

Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

TĚŠÍNSKÁ, Iva, Bohuslav RITTICH, Alena ŠPANOVÁ and Milan BARTOŠ

Basic information

Original name

Isolation of PCR-ready DNA from Mycobacterial cells using magnetic particles

Name in Czech

Izolace mykobakteriální DNA v kvalitě pro PCR pomocí magnetických částic

Authors

TĚŠÍNSKÁ, Iva (203 Czech Republic), Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic, guarantor), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic) and Milan BARTOŠ (203 Czech Republic)

Edition

Pardubice, Česká republika, 11th International Symposium on Separation Sciences ISSS 2005, p. 299-299, 1 pp. 2005

Publisher

Univerzita Pardubice

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00012824

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-7194-771-7

Keywords in English

Mycobacterium; DNA; PCR
Změněno: 23/11/2006 08:51, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Abstract

V originále

For this study, chicken erythrocyte DNA and calf liver RNA were used. For both types of nucleic acids, we compared the binding capacity of the following particles: non-magnetic particles based on silica, magnetic particles based on ferrite, and magnetic particles P(HEMA-co-GMA) microspheres covered with carboxylic groups. A binding buffer containing 8% PEG and 2M NaCl (final concentration) was shown to be the most appropriate combination for further studies. Separated DNA was eluted using TE buffer. The knowledge acquired was used for the development of a PCR-ready mycobacterial DNA isolation technique. Mycobacterial DNA from the eluate was detected by amplification of the dnaJ gene. The primers Multidnajf and MultidnaJr amplify a product 140 bp long. The sensitivity of the reaction is 5 . 10-3 ng/ul (5.95. 10+2 copies).

In Czech

Byly stanoveny vazebné kapacity DNA z kuřecích erythrocytů a RNA z hovězích jater na následující částice: silikagel, magnetické feritové částice a magnetické P(HEMA-co-GMA)mikročástice obsahující karboxylové skupiny. Jako nejvhodnější vazebný pufr byl zjištěn 8% PEG a 2M NaCl (konečná koncentrace). Z částic byla DNA eluována pomocí TE pufru. Získané znalosti byly využity při izolaci mykobakteriální DNA v kvalitě vhodné pro PCR. Mykobakteriální DNA byla detekována amplifikací genu dnaj. Pomocí primerů Multidnajf a MultidnaJr byl amplifikován produkt o velikosti 140 bp. Citlivost stanovení byla 5,0 x 10-3 ng/ul (5,95 x 10+2 kopií buněk).

Links

GA203/05/2256, research and development project
Name: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Czech Science Foundation, Magnetic stimuli-responsive hydrophilic polymer microspheres for biomedicine/bioengineering
MZE0002716201, plan (intention)
Name: Zdravá zvířata a bezpečné potraviny jako základ pro zdraví lidí