J 2005

Charakterizace proteomu bakteriofága 812

ZDRÁHAL, Zbyněk, Luděk EYER, Hana KONEČNÁ and Jan PREISLER

Basic information

Original name

Charakterizace proteomu bakteriofága 812

Name in Czech

Charakterizace proteomu bakteriofága 812

Name (in English)

Charakterization of bacteriphage 812 proteome

Authors

ZDRÁHAL, Zbyněk (203 Czech Republic), Luděk EYER (203 Czech Republic), Hana KONEČNÁ (203 Czech Republic) and Jan PREISLER (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Chemické listy, Praha, Asociace Českých chemických společností, 2005, 0009-2770

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10406 Analytical chemistry

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 0.445

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00012894

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000234182000014

Keywords in English

bakteriophage; proteome; mass spectrometry; gel electrophoresis; anomal migration

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 26/6/2009 10:40, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Abstract

V originále

Lytický bakteriofág 812 patří mezi slibné kandidáty na terapii stafylokokových infekcí jako náhrada léčby antibiotiky. Proteom bakteriofága 812 byl analyzován vybranými technikami hmotnostní spektrometrie a separace. Bylo identifikováno jedenáct proteinů z toho sedm poprvé. Gelová elektroforéza s peptidovým mapováním byla shledána nejúčinnější technikou pro celkovou analýzu; HPLC-ESI MS byla použita pro potvrzení ve sporných případech. Zdánlivě anomální migrace hlavního proteinu bičíkové pochvy (812_mtsp) byla vysvětlena po separaci gelovou elektroforézou za upravených podmínek a peptidovým mapováním pomocí MALDI TOF a TOF/TOF MS. Tři fragmenty proteinu 812_mtsp o podobné velikosti, které původně migrovaly v jedné zóně, byly odděleny a identifikovány. Charakterizace proteomu bakteriofága 812 je předpokladem pro budoucí srovnání standardního fága 812 s jeho mutanty a příbuznými fágy a korelaci změn proteomu se změnami rozmezí hostitele.

In English

A lytic bacteriophage 812 ranks among to promising candidates for phage therapy, which emerges as an alternative to antibiotics for treatment of staphylococcal infections. Proteome of bacteriophage 812 was analyzed using various mass spectrometry techniques. Eleven proteins were identified, of which seven proteins were identified for the first time. Gel electrophoresis with peptide mass fingerprinting was found the most efficient for overall analysis; HPLC-ESI MS was used for confirmation in dubious cases. Seemingly abnormal migration of main tail sheath protein (812_mtsp) was explained after adjustment of gel electrophoresis conditions and peptide mass fingerprinting combined with MALDI TOF/TOF MS results. Three similarly-sized 812_mtsp fragments, which originally migrated in one band, were separated and identified. Proteome characterization of bacteriophage 812 is a prerequisite for future comparison of the standard-type phage 812 with its mutants and related phages to correlate proteome changes with their different host range.

Links

GA203/03/0515, research and development project
Name: Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
Investor: Czech Science Foundation, Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations