Detailed Information on Publication Record
2005
Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L.
ŠMERDA, Jakub, Ivo SEDLÁČEK, Zdenka PÁČOVÁ, Eva DURNOVÁ, Alexandra SMÍŠKOVÁ et. al.Basic information
Original name
Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L.
Name in Czech
Paenibacillus mendelii sp. nov., bakterie izolovaná z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého (Pisum sativum L.)
Authors
ŠMERDA, Jakub (203 Czech Republic, guarantor), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic), Zdenka PÁČOVÁ (203 Czech Republic), Eva DURNOVÁ (203 Czech Republic), Alexandra SMÍŠKOVÁ (203 Czech Republic) and Ladislav HAVEL (203 Czech Republic)
Edition
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK, Society for General Microbiology, 2005, 1466-5026
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
Impact factor
Impact factor: 2.744
RIV identification code
RIV/00216224:14310/05:00014428
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000233349200020
Keywords in English
Paenibacillus mendelii; new taxa; 16S rRNA; DNA-DNA hybridization
Změněno: 11/1/2006 11:12, Ing. Jakub Šmerda, Ph.D.
V originále
A Gram-variable, facultatively anaerobic, endospore-forming bacterium was isolated from surface-sterilized seeds of the garden pea and characterized with phenotypic and molecular methods. A PCR with the Paenibacillus-specific primer PAEN515F and the 16S rRNA gene sequence indicated that strain C/2T belongs to the genus Paenibacillus and is closely related to Paenibacillus phyllosphaerae (94,0 % sequence similarity). Strain C/2T generated a unique phenotypic profile, in particular for the production of acid from substrates. The DNA G+C content (50,8 mol%) and the major fatty acid (anteiso-C15 : 0) are consistent with the genus Paenibacillus. DNA-DNA hybridization distinguished strain C/2T from other phylogenetically related Paenibacillus species and, therefore, strain C/2T (=CCM 4839T=LMG 23002T) is here described as the type strain of a novel species, for which the name Paenibacillus mendelii sp. nov. is proposed.
In Czech
Gram variabilní, fakultativně anaerobní bakterie tvořící endospory, byla izolována z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého a charakterizována pomocí fenotypových a genotypových metod. PCR s primerem specifickými pro rod Paenibacillus (PAEN515F) a sekvence genu 16S rRNA indikovala, že kmen C/2T náleží do rodu Paenibacillus a je blízce příbuzný druhu Paenibacillus phyllosphaerae (94,O % podobnost sekvencí). Kmen C/2T vytváří jedinečné fenotypové profily, především v produkci kyseliny ze substrátů. Obsah guaninu a cytozinu (50,8 mol%) a převažující mastná kyselina (anteiso-C15 : 0) odpovídají charakterizaci rodu Paenibacillus. DNA-DNA hybridizace odlišuje kmen C/2T od ostatních, fylogeneticky příbuzných druhů rodu Paenibacillus a proto byl kmen C/2T (=CCM 4839T=LMG 23002T) popsán jako nový druh Paenibacillus mendelii.
Links
| MSM0021622416, plan (intention) |
|