Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{621618,
author = {Matějková, Petra and Šmajs, David and Norris, S.J. and Weinstock, G.M.},
address = {Brno},
booktitle = {Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů},
edition = {2005},
keywords = {Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones},
language = {cze},
location = {Brno},
isbn = {80-210-3635-4},
pages = {11-11},
publisher = {Přírodovědecká fakulta MU},
title = {Studium genové exprese u T. pallidum.},
year = {2005}
}
TY - JOUR
ID - 621618
AU - Matějková, Petra - Šmajs, David - Norris, S.J. - Weinstock, G.M.
PY - 2005
TI - Studium genové exprese u T. pallidum.
PB - Přírodovědecká fakulta MU
CY - Brno
SN - 8021036354
KW - Treponema pallidum subsp. pallidum
KW - gene expression profiling
KW - BAC clones
N2 - Spirocheta Treponema pallidum subsp. pallidum je původcem venerické syfilis, vysoce invazivního onemocnění postihujícího v pozdním stadiu systémově celý organismus. Nemožnost kontinuální kultivace v in vitro podmínkách vyžaduje užití genomických přístupů pro výzkum tohoto neobvyklého patogenu. Byla připravena BAC knihovna chromozomální DNA T. pallidum v E. coli. 19 klonů této knihovny představuje minimální set obsahující 99,8 % předpovězených genů (ORF). Byla stanovena exprese genů T. pallidum v E. coli. Expresní profil genů v BAC knihovně představuje první krok pro studium regulace genové exprese genů T. pallidum. 5 treponemálních genů kódujících proteiny s domnělou regulační funkcí bylo naklonováno do expresních vektorů pBAD kompatibilních s replikačním systémem BAC. V expresním vektoru pBAD jsou tyto geny pod kontrolou arabinózového promotoru, který umožňuje regulovat jejich expresi pomocí hladiny arabinózy v kultivačním mediu. Tyto vektory byly transformovány do minimální sady BAC knihovny. Celková RNA celé sady transformované vektorem s domnělým transkripčním regulátorem byla porovnána s relevantní kontrolou s vektorem bez inzertu metodami DNA microarray hybridizace na čipu T. pallidum a kvantitativní PCR. Byly vyšetřeny geny rpoN, fhlA, hisK, soj a troR. Proteiny RpoN, FhlA a HisK byly potvrzeny jako pozitivní regulátory a produkt genu soj jako negativní regulátor. U genu troR nebyla potvrzena jeho negativní regulační funkce. Byla také vyšetřena RNA izolovaná z časově omezené kultivace treponem na tkáňových kulturách králičích epiteliálních buněk a z experimentálních lézí na králičí kůži. RNA z takto získaných organismů byla podrobena expresní analýze metodou kvantitativní PCR a výsledky byly porovnány s expresním profilem treponem izolovaných z králičích testes.
ER -
MATĚJKOVÁ, Petra, David ŠMAJS, S.J. NORRIS and G.M. WEINSTOCK. Studium genové exprese u T. pallidum. (Gene expression profiling in T. pallidum). In \textit{Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů}. 2005th ed. Brno: Přírodovědecká fakulta MU, 2005, p.~11. ISBN~80-210-3635-4.
|
