Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS. Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum. (Identification of gene expression regulators in Treponema pallidum.). In Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Přírodovědecká fakulta MU, 2005, p. 5. ISBN 80-210-3635-4.

Basic information

Original name

Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum.

Name (in English)

Identification of gene expression regulators in Treponema pallidum.

Authors

ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS

Edition

Brno, Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 5-5, 2005

Publisher

Přírodovědecká fakulta MU

---

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-210-3635-4

Keywords in English

Treponema pallidum ssp. pallidum; regulation of gene expression

Tags

regulation of gene expression, Treponema pallidum ssp. pallidum

---

Abstract

V originále

Metodou real-time RT PCR jsme vyšetřili regulační funkci treponemálních genů rpoN (kódujícího sigma-54 faktor) a fhlA (kódujícího domnělý transkripční faktor). Tyto geny byly naklonovány do expresních plazmidů pBAD/HisB kompatibilních s replikačním systémem BAC. Exprese klonovaných genů byla regulována koncentrací arabinózy v kultivačním mediu. Vzniklé konstrukty obsahovaly izolovaně naklonované geny i plazmidy obsahující oba geny současně. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy za aerobních a semianaerobních podmínek Za neindukovaných aerobních podmínek roste kmen nesoucí konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA výrazně pomaleji než ostatní vzorky. Po indukci arabinózou pozorujeme pomalejší růst u všech kmenů E. coli nesoucí geny rpoN a fhlA a také u kmene nesoucího konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA. Protože T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Konstrukty s geny rpoN a fhlA byly transformovány do E. coli DH10B s kosmidy DSTP147 a DSTP085. Z těchto kmenů byla izolována RNA 60 a 120 minut po indukci arabinózou a hladina transkriptů vyšetřena kvantitativní RT PCR. Nejvíce jsou regulovány geny TP 9 (tprA), TP 28 (předpovězený gen pro hemolysin), TP 30 (groEL), TP 1037 (hlyIII) a TP 1038 (TpF1). Regulační proteiny RpoN a FhlA přitom spolupracují na pozitivní regulaci transkripce těchto genů.

In English

The possible regulatory functions of two treponemal genes, rpoN (encoding sigma-54 factor) and fhlA (encoding putative transcriptional regulator) were tested using real-time RT PCR. Genes TP0009 (tprA), TP0028 (putative hemolysin gene), TP0030 (groEL), TP1037 (hlyIII) and TP1038 (TpF1)were found to be regulated by RpoN a FhlA proteins.

---

Links

GA310/04/0021, research and development project	Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete
MSM0021622415, plan (intention)	Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NI7351, research and development project	Name: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice Investor: Ministry of Health of the CR