ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS. Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum. (Identification of gene expression regulators in Treponema pallidum.). In Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Přírodovědecká fakulta MU, 2005, p. 5. ISBN 80-210-3635-4.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Identifikace regulátorů genové exprese u Treponema pallidum.
Name (in English) Identification of gene expression regulators in Treponema pallidum.
Authors ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS.
Edition Brno, Sborník příspěvků IX. Pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 5-5, 2005.
Publisher Přírodovědecká fakulta MU
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Organization unit Faculty of Medicine
ISBN 80-210-3635-4
Keywords in English Treponema pallidum ssp. pallidum; regulation of gene expression
Tags regulation of gene expression, Treponema pallidum ssp. pallidum
Changed by Changed by: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Changed: 6/2/2006 15:35.
Abstract
Metodou real-time RT PCR jsme vyšetřili regulační funkci treponemálních genů rpoN (kódujícího sigma-54 faktor) a fhlA (kódujícího domnělý transkripční faktor). Tyto geny byly naklonovány do expresních plazmidů pBAD/HisB kompatibilních s replikačním systémem BAC. Exprese klonovaných genů byla regulována koncentrací arabinózy v kultivačním mediu. Vzniklé konstrukty obsahovaly izolovaně naklonované geny i plazmidy obsahující oba geny současně. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy za aerobních a semianaerobních podmínek Za neindukovaných aerobních podmínek roste kmen nesoucí konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA výrazně pomaleji než ostatní vzorky. Po indukci arabinózou pozorujeme pomalejší růst u všech kmenů E. coli nesoucí geny rpoN a fhlA a také u kmene nesoucího konstrukt s oběma geny rpoN a fhlA. Protože T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Konstrukty s geny rpoN a fhlA byly transformovány do E. coli DH10B s kosmidy DSTP147 a DSTP085. Z těchto kmenů byla izolována RNA 60 a 120 minut po indukci arabinózou a hladina transkriptů vyšetřena kvantitativní RT PCR. Nejvíce jsou regulovány geny TP 9 (tprA), TP 28 (předpovězený gen pro hemolysin), TP 30 (groEL), TP 1037 (hlyIII) a TP 1038 (TpF1). Regulační proteiny RpoN a FhlA přitom spolupracují na pozitivní regulaci transkripce těchto genů.
Abstract (in English)
The possible regulatory functions of two treponemal genes, rpoN (encoding sigma-54 factor) and fhlA (encoding putative transcriptional regulator) were tested using real-time RT PCR. Genes TP0009 (tprA), TP0028 (putative hemolysin gene), TP0030 (groEL), TP1037 (hlyIII) and TP1038 (TpF1)were found to be regulated by RpoN a FhlA proteins.
Links
GA310/04/0021, research and development projectName: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NI7351, research and development projectName: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministry of Health of the CR
PrintDisplayed: 29/7/2024 10:35