JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem. (Molecular interaction of colicin U with immunity protein). In Abstrakta 49. Studentské vědecké konference. 2005. |
Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
|
Basic information | |
---|---|
Original name | Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem. |
Name (in English) | Molecular interaction of colicin U with immunity protein |
Authors | JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor). |
Edition | Abstrakta 49. Studentské vědecké konference, 2005. |
Other information | |
---|---|
Original language | Czech |
Type of outcome | Conference abstract |
Field of Study | Genetics and molecular biology |
Country of publisher | Czech Republic |
Confidentiality degree | is not subject to a state or trade secret |
RIV identification code | RIV/00216224:14110/05:00013192 |
Organization unit | Faculty of Medicine |
Keywords in English | colicin U; colicin Y; immunity protein |
Tags | colicin U, colicin Y, immunity protein |
Changed by | Changed by: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Changed: 8/4/2010 16:28. |
Abstract |
---|
Cíl: Identifikovat aminokyselinové zbytky C-koncové domény kolicinu U zprostředkující vazbu se svým imunitním proteinem. Bylo zkonstruováno více než 40 mutantních kolicinových genů U/Y a účinek jimi syntetizovaných proteinů byl testován na imunitní proteiny kolicinu U a Y. Koliciny s většinou bodových mutací byly rozpoznávány imunitními proteiny stejně jako původní koliciny. Koliciny s bodovými mutacemi G580V a F576Y byly rozpoznávány signifikantně méně a prokázaly jednoznačný význam aminokyselinových zbytků G580 a F576 pro interakci kolicinu U s imunitním proteinem kolicinu U. Další slabé interakční místo, aminokyselinový zbytek N605, leží distálně od předchozích dvou. U kolicinu Y byla identifikována aminokyselina Y586 a slabší interakční místa A589 a A577-I578, jež se účastní vazby s imunitním proteinem kolicinu Y. |
Abstract (in English) |
---|
Colicin U is an antibacterial pore-forming toxin produced by Shigella boydii that kills sensitive bacterial strains of Escherichia coli and closely related organisms The colicin-immunity protein recognition is a suitable model for studying protein-protein interactions. More than 40 mutant colicins were prepared and their toxic effect was tested on the sensitive bacteria transformed with plasmid harboring either cui (colicin U immunity) gene or cyi (colicin Y immunity) gene. Colicin U variants with point mutations in the hydrophobic hairpin, F576Y and G580V, were significantly less recognized by Cui, in addition to colicin U with K609R mutation localized downstream of hydrophobic hairpin. In the colicin Y pore-forming domain, Y586 and A589 were identified as interaction sites with Cyi in the hydrophobic hairpin, in addition to A577-I578 in the helix 8 of colicin Y pore forming domain. |
Links | |
---|---|
GA310/03/1091, research and development project | Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem |
Investor: Czech Science Foundation |