Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem. (Molecular interaction of colicin U with immunity protein). In Abstrakta 49. Studentské vědecké konference. 2005.

Basic information

• Original name: Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.
• Name (in English): Molecular interaction of colicin U with immunity protein
• Authors: JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Abstrakta 49. Studentské vědecké konference, 2005.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/05:00013192
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: colicin U; colicin Y; immunity protein
• Tags: colicin U, colicin Y, immunity protein

Abstract

Cíl: Identifikovat aminokyselinové zbytky C-koncové domény kolicinu U zprostředkující vazbu se svým imunitním proteinem. Bylo zkonstruováno více než 40 mutantních kolicinových genů U/Y a účinek jimi syntetizovaných proteinů byl testován na imunitní proteiny kolicinu U a Y. Koliciny s většinou bodových mutací byly rozpoznávány imunitními proteiny stejně jako původní koliciny. Koliciny s bodovými mutacemi G580V a F576Y byly rozpoznávány signifikantně méně a prokázaly jednoznačný význam aminokyselinových zbytků G580 a F576 pro interakci kolicinu U s imunitním proteinem kolicinu U. Další slabé interakční místo, aminokyselinový zbytek N605, leží distálně od předchozích dvou. U kolicinu Y byla identifikována aminokyselina Y586 a slabší interakční místa A589 a A577-I578, jež se účastní vazby s imunitním proteinem kolicinu Y.

Abstract (in English)

Colicin U is an antibacterial pore-forming toxin produced by Shigella boydii that kills sensitive bacterial strains of Escherichia coli and closely related organisms The colicin-immunity protein recognition is a suitable model for studying protein-protein interactions. More than 40 mutant colicins were prepared and their toxic effect was tested on the sensitive bacteria transformed with plasmid harboring either cui (colicin U immunity) gene or cyi (colicin Y immunity) gene. Colicin U variants with point mutations in the hydrophobic hairpin, F576Y and G580V, were significantly less recognized by Cui, in addition to colicin U with K609R mutation localized downstream of hydrophobic hairpin. In the colicin Y pore-forming domain, Y586 and A589 were identified as interaction sites with Cyi in the hydrophobic hairpin, in addition to A577-I578 in the helix 8 of colicin Y pore forming domain.

Links

• GA310/03/1091, research and development project: Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation