Detailed Information on Publication Record
2005
Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.
JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJSBasic information
Original name
Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem.
Name (in English)
Molecular interaction of colicin U with immunity protein
Authors
JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Abstrakta 49. Studentské vědecké konference, 2005
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14110/05:00013192
Organization unit
Faculty of Medicine
Keywords in English
colicin U; colicin Y; immunity protein
Tags
Změněno: 8/4/2010 16:28, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
Cíl: Identifikovat aminokyselinové zbytky C-koncové domény kolicinu U zprostředkující vazbu se svým imunitním proteinem. Bylo zkonstruováno více než 40 mutantních kolicinových genů U/Y a účinek jimi syntetizovaných proteinů byl testován na imunitní proteiny kolicinu U a Y. Koliciny s většinou bodových mutací byly rozpoznávány imunitními proteiny stejně jako původní koliciny. Koliciny s bodovými mutacemi G580V a F576Y byly rozpoznávány signifikantně méně a prokázaly jednoznačný význam aminokyselinových zbytků G580 a F576 pro interakci kolicinu U s imunitním proteinem kolicinu U. Další slabé interakční místo, aminokyselinový zbytek N605, leží distálně od předchozích dvou. U kolicinu Y byla identifikována aminokyselina Y586 a slabší interakční místa A589 a A577-I578, jež se účastní vazby s imunitním proteinem kolicinu Y.
In English
Colicin U is an antibacterial pore-forming toxin produced by Shigella boydii that kills sensitive bacterial strains of Escherichia coli and closely related organisms The colicin-immunity protein recognition is a suitable model for studying protein-protein interactions. More than 40 mutant colicins were prepared and their toxic effect was tested on the sensitive bacteria transformed with plasmid harboring either cui (colicin U immunity) gene or cyi (colicin Y immunity) gene. Colicin U variants with point mutations in the hydrophobic hairpin, F576Y and G580V, were significantly less recognized by Cui, in addition to colicin U with K609R mutation localized downstream of hydrophobic hairpin. In the colicin Y pore-forming domain, Y586 and A589 were identified as interaction sites with Cyi in the hydrophobic hairpin, in addition to A577-I578 in the helix 8 of colicin Y pore forming domain.
Links
| GA310/03/1091, research and development project |
|