a 2005

Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS

Basic information

Original name

Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.

Name (in English)

Putative gene regulators in Treponema pallidum

Authors

ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Abstrakta 49. Studenstské vědecké konference, 2005

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/05:00013194

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords in English

Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones

Tags

Změněno: 8/4/2010 17:36, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Abstract

ORIG EN

V originále

Cíl: Ověřit funkčnost domnělých regulátorů RpoN (54) a FhlA a stanovit spektrum genů těmito regulátory ovlivňovaných. Identifikovat 54 závislé promotory. Materiál a metody: T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme tedy monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Gen rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující domnělý transkripční faktor) byly naklonovány do expresních arabinózou indukovatelných plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Závěr: Proteiny RpoN a FhlA jsou pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci genů spřažených s mnoha buněčnými procesy.

In English

Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes.

Links

GA310/04/0021, research and development project
Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NI7351, research and development project
Name: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
Investor: Ministry of Health of the CR