Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS. Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum. (Putative gene regulators in Treponema pallidum). In Abstrakta 49. Studenstské vědecké konference. 2005.

Basic information

• Original name: Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum.
• Name (in English): Putative gene regulators in Treponema pallidum
• Authors: ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Abstrakta 49. Studenstské vědecké konference, 2005.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/05:00013194
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones
• Tags: BAC clones, gene expression profiling, Treponema pallidum subsp. pallidum

Abstract

Cíl: Ověřit funkčnost domnělých regulátorů RpoN (54) a FhlA a stanovit spektrum genů těmito regulátory ovlivňovaných. Identifikovat 54 závislé promotory. Materiál a metody: T. pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro, expresi treponemálních genů jsme tedy monitorovali v 19 klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Gen rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující domnělý transkripční faktor) byly naklonovány do expresních arabinózou indukovatelných plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Závěr: Proteiny RpoN a FhlA jsou pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci genů spřažených s mnoha buněčnými procesy.

Abstract (in English)

Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes.

Links

• GA310/04/0021, research and development project: Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NI7351, research and development project: Name: Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice

Investor: Ministry of Health of the CR