Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.

JANALÍKOVÁ, Magda a David ŠMAJS. Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny. Online. In Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005. 2005, [citováno 2024-04-24]

Základní údaje

• Originální název: Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
• Název anglicky: Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins
• Autoři: JANALÍKOVÁ, Magda (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)
• Vydání: Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005, 2005.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/05:00013197
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova anglicky: colicin U; colicin Y; immunity protein
• Štítky: colicin U, colicin Y, immunity protein

Anotace

Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) je zajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejich producenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U a Y.

Anotace anglicky

Colicins are antibacterial toxins produced by strains of Escherichia coli and related bacteria that provide a selective advantage against closely related strains in the competition among bacteria. Toxic effect that is mediated by the C-terminal domain is depolarization of the cytoplasmic membrane of sensitive cells. The plasmid encoded immunity protein ensures that producers are protected against the effect of their own colicin. The recognition of soluble colicin by the membrane-bounded immunity protein is a suitable model for studying protein-protein interactions. The pair of colicins U and Y had 87% identity in their pore-forming domains but the corresponding producers were not cross-immune. The amino acids of colicin U (Y) were mutated into those appearing in the sequence of colicin Y (U) and changes in the interactions between mutated colicins and immunity proteins were monitored and interactions sites were identified.

Návaznosti

• GA310/03/1091, projekt VaV: Název: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Grantová agentura ČR, Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací