Detailed Information on Publication Record
2005
Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJSBasic information
Original name
Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
Name (in English)
Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins
Authors
JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Sborník abstraktů XIV. Tomáškových dnů 2005, 2005
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14110/05:00013197
Organization unit
Faculty of Medicine
Keywords in English
colicin U; colicin Y; immunity protein
Tags
Změněno: 8/4/2010 17:14, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
V originále
Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) je zajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejich producenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U a Y.
In English
Colicins are antibacterial toxins produced by strains of Escherichia coli and related bacteria that provide a selective advantage against closely related strains in the competition among bacteria. Toxic effect that is mediated by the C-terminal domain is depolarization of the cytoplasmic membrane of sensitive cells. The plasmid encoded immunity protein ensures that producers are protected against the effect of their own colicin. The recognition of soluble colicin by the membrane-bounded immunity protein is a suitable model for studying protein-protein interactions. The pair of colicins U and Y had 87% identity in their pore-forming domains but the corresponding producers were not cross-immune. The amino acids of colicin U (Y) were mutated into those appearing in the sequence of colicin Y (U) and changes in the interactions between mutated colicins and immunity proteins were monitored and interactions sites were identified.
Links
| GA310/03/1091, research and development project |
| ||
| MSM0021622415, plan (intention) |
|