HUBENÝ, Jan. Enhancement of Images Acquired using Optical Microscope. In Proceedings of the 1st International Summer School on Computational Biology. Brno (Česká republika): Masarykova universita, 2005, p. 29-38. ISBN 80-210-3907-8.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Enhancement of Images Acquired using Optical Microscope
Name in Czech Vylepšení obrázků pořízených optickým mikroskopem
Authors HUBENÝ, Jan (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Brno (Česká republika), Proceedings of the 1st International Summer School on Computational Biology, p. 29-38, 2005.
Publisher Masarykova universita
Other information
Original language English
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14330/05:00014836
Organization unit Faculty of Informatics
ISBN 80-210-3907-8
Keywords in English nonlinear diffusion; biomedical application; AOS numerical scheme; confocal microscopy
Tags AOS numerical scheme, biomedical application, confocal microscopy, nonlinear diffusion
Changed by Changed by: RNDr. Jan Hubený, učo 4012. Changed: 22/2/2006 14:11.
Abstract
Due to the limitations of the scanning process, the image data acquired using confocal microscope are of-ten corrupted by the noise. Therefore some image preprocessing, which would reduce the noise without degradation of the underlying image, is needed before any further stage of image analysis. In this review we will discuss several well-known nonlinear diffusion filters, as they were published in the last decade. These filters are based on evolution of nonlinear partial differential equations. Unlike the common linear filters, they significantly reduce the amount of noise in the image while preserving details or even enhancing some edges. We will present efficient numerical schemes for solving such equations. Last but not least practical examples, comparison of the behaviour of individual methods and our experience with these filters will be shown.
Abstract (in Czech)
Obrazová data pořízená konfokálním mikroskopem jsou často zatížena šumem. Proto je nutné obrázek upravit před dalším zpracováním. Je žádoucí odstranit šum za současného zachování hran a významné informace. V tom to čl8nku budeme diskutovat několik dobře známých nelineárních difúzních filtrů tak jak byly publikovány v posledních deseti letech. V pozadí těchto filtrů je řešení parciálních diferenciálních rovnic. Narozdíl od běžně užívaných filtrů nelineární difúzní filtry významě potlačují šum a zároveň zachovávají hrany a významnou obrazovou informaci. Dále ukážeme efektivní numerická schémata k výpočetní realizaci těchto filtrů. Nakonec ukážeme a okomentujeme praktické příklady a naše zkušenosti s používáním těchto fitrů.
Links
MSM0021622419, plan (intention)Name: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Highly Parallel and Distributed Computing Systems
PrintDisplayed: 13/5/2024 10:20