Ploidy Level Variability in South American Fescues (Festuca L., Poaceae): Use of Flow Cytometry in Up to 5 1/2-year-Old Caryopses and Herbarium Specimens.

ŠMARDA, Petr and Dan STANČÍK. Ploidy Level Variability in South American Fescues (Festuca L., Poaceae): Use of Flow Cytometry in Up to 5 1/2-year-Old Caryopses and Herbarium Specimens. Plant Biology. Stuttgart: Thieme, Georg Thieme Verlag, 2006, vol. 8, No 1, p. 73-80. ISSN 1435-8603.

Basic information

• Original name: Ploidy Level Variability in South American Fescues (Festuca L., Poaceae): Use of Flow Cytometry in Up to 5 1/2-year-Old Caryopses and Herbarium Specimens.
• Name in Czech: Variabilita ploidních úrovní jihoamerických kostřav (Festuca L., Poaceae): použití flow cytometrie až u 5 1/2 let starých obilek a herbářových položek.
• Authors: ŠMARDA, Petr (203 Czech Republic, guarantor) and Dan STANČÍK (203 Czech Republic).
• Edition: Plant Biology, Stuttgart, Thieme, Georg Thieme Verlag, 2006, 1435-8603.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Article in a journal
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Impact factor: Impact factor: 2.059
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/06:00015593
• Organization unit: Faculty of Science
• UT WoS: 000235078600008
• Keywords in English: Polyploidy; chromosome number; Andes; biogeography; dessicated tissue
• Tags: Andes, biogeography, chromosome number, dessicated tissue, polyploidy
• Tags: International impact, Reviewed

Abstract

Ploidy levels and chromosome numbers for 24 species of Festuca L. from 29 sites in Bolivia, Colombia, Ecuador and Venezuela are given. The ploidy level of 22 species is reported for the first time. A higher proportion of tetraploids in north South America and the high frequence of polyploids in the whole continent are documented. In combination with chromosome counts, ploidy level was determined using flow cytometry in 4- to 5 1/2-year-old herbarium specimens and mature caryopses. Flow cytometric determination from seeds was more reliable than determination from herbarium specimens. In herbarium specimens, the youngest, fresh green leaves, still hidden in sheaths seem to be most suitable for cytometric determination. In old, brownish leaves or poorly preserved herbarium specimens, the degradation of DNA signal in flow histograms was documented. DNA content measured in seeds was always higher than that measured in herbarium specimens, which may caused by the presence of different cytosolic compounds. About 15% difference in relative DNA content of F. sodiroana and F. vaginalis was proved in simultaneous measurement in seeds.

Abstract (in Czech)

V práci jsou dokumentovány ploidní stupně a počty chromozomů 24 druhů rodu Festuca L. pocházejících z 29 lokalit v Bolívii, Kolumbii, Ekvádoru a Venezuele. Ploidní stupeň 22 druhů je dokumentován poprvé. Na celém jihoamerickém kontinentu dominují vyšší polyploidi, s vyšším zastoupením tetraploidů v severní čísti kontinentu. V kombinaci s počítáním chromozomů byl ploidní stupeň stanovován pomocí flow cytometrie u 4 až 5 a půl roku starých herbářových položek a zralých obilek. Cytometrická měření obilek poskytovala lepší výsledky než měření herbářových položek. Jako nejvhodnější pro pro cytometrická měření u herbářových položek se jevily nejmladší zeléné listy, ještě skryté v pochvách. U starých, hnědavých listů nebo hůře konzervovaných herbářových položek byl DNA signál flow histogramů degradovaný. Obsah DNA vzorků měřený u semen byl oproti herbářovým položkám vždy nižší, což může být zapříčiněno různým zastoupením obsahových látek v měřených buňkách. Mezi F. sodiroana and F. vaginalis byl simultáním měřením obilek pozorován až 15-ti procentní rozdíl v relativním obsahu DNA.

Links

• GD524/05/H536, research and development project: Name: Evolučně ekologická analýza biologických systémů: výzkumné centrum DSP

Investor: Czech Science Foundation, Evolutionary ecological analysis of biological systems: research centrum for PhD studies

• LC06073, research and development project: Name: Centrum pro výzkum biodiverzity

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center

• MSM0021622416, plan (intention): Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time