TRNKOVÁ, Libuše, Radka MIKELOVÁ, František JELEN and René KIZEK. Využití eliminační voltametrie k rozlišení redukčních signálů adeninu a cytosinu v hetero-deoxyoligonukleotidech (aplication of elimination voltammetry to the resolution of adenine and cytosine reduction signals in hetero-deoxyoligonucleotides). In Sborník příspěvků VI. Pracovního setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Masarzkova universita, 2006, p. 108-109, 125 pp. ISBN 80-210-3943-4.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Využití eliminační voltametrie k rozlišení redukčních signálů adeninu a cytosinu v hetero-deoxyoligonukleotidech
Name in Czech Využití eliminační voltametrie k rozlišení redukčních signálů adeninu a cytosinu v hetero-deoxyoligonukleotidech
Name (in English) aplication of elimination voltammetry to the resolution of adenine and cytosine reduction signals in hetero-deoxyoligonucleotides
Authors TRNKOVÁ, Libuše (203 Czech Republic, guarantor), Radka MIKELOVÁ (203 Czech Republic), František JELEN (203 Czech Republic) and René KIZEK (203 Czech Republic).
Edition Brno, Sborník příspěvků VI. Pracovního setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků, p. 108-109, 125 pp. 2006.
Publisher Masarzkova universita
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10405 Electrochemistry
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00016640
Organization unit Faculty of Science
ISBN 80-210-3943-4
Keywords in English elimination voltammetrywith linear scan; adenine; cytosine; reduction signals; hetero-deoxyoligonucleotides
Tags adenine, cytosine, elimination voltammetrywith linear scan, hetero-deoxyoligonucleotides, reduction signals
Changed by Changed by: prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc., učo 1027. Changed: 10/2/2006 14:33.
Abstract
Úvod Před deseti lety byly publikovány teoretické základy nové elektrochemické metody-Eliminační voltametrie s lineární polarizací elektrody (Elimination Voltammetry with Linear Scan-EVLS) [1,2]. Principem je matematické zpracování voltametrických křivek s požadavkem některé dílčí proudy eliminovat a jiné zachovat. To je splněno díky tzv. eliminační funkci vyjádřené jako lineární kombinace celkových voltametrických proudů naměřených při různých rychlostech polarizace. Bylo zjištěno, že pomocí funkce E4 (eliminace kinetického a kapacitního proudu se zachováním proudu difúzního), EVLS poskytuje velmi citlivý signál pro ireverzibilní děj zcela adsorbované elektroaktivní částice [3-6]. Na základě této skutečnosti vznikla myšlenka kombinovat EVLS a adsorptivní rozpouštěcí techniku (Adsorptive stripping-AdS) a úspěšně separovat potenciálově velmi blízké procesy, jejichž výsledkem jsou překrývající se voltametrické píky [1,4]. Díky AdS EVLS byly na rtuťových elektrodách u oligodeoxynukleotidů (ODNs) rozděleny redukční signály adeninu (A) a cytosinu (C) ve směsi homo-ODNs [7] nebo v hetero-ODNs včetně hairpinu [8,9]. Separace signálů A a C v syntetických ODNs (9-merech) v závislosti na různých experimentálních podmínkách a na sekvenci bází je předmětem tohoto sdělení. Výsledky a diskuse Předložený příspěvek se zabývá simultánní aplikací adsorptivní techniky (AdS) a eliminační voltametrie (EVLS) k rozlišení redukčních signálů A a C u tří hetero-ODNs se stejným poměrem A/C, ale rozdílnou sekvencí. Na visící rtuťové elektrodě (HMDE) byly po dobu 0 - 120s a při potenciálu 0,1 V adsorbovány tři ODNs : 5- CCC AAA CCC -3 (H3), 5-CAC CAC CAC - 3 (H4), a 5- CCC ACA ACC - 3 (H5) a měřeny jejich redukční odezvy při různých rychlostech polarizace. Získaná voltametrická data (LSV křivky) byla podrobena eliminační proceduře. . Pro adsorbovanou elektroaktivní částici tato funkce poskytuje dobře čitelný EVLS signál, tj. pík (peak ), který přechází v ostrý protipík (counterpeak ), a vytváří tak charakteristický pík-protipík (peak-counterpeak, ). Teoretická hodnota poměru , kde a reprezentují výšky píku a protipíku je 0.4097 . Bylo zjištěno, že adeninový eliminační signál je tomuto poměru velmi blízko. Cytosinový eliminační signál se od této teoretické hodnoty značně liší a jeho elektrodový proces je komplikovanější. Nový elektrochemický přístup - AdS EVLS ukázal možnost elektroanalýzy ODNs v závislosti na pH a na sekvenci bází v oligonukleotidovém řetězci. Závěr Po celou dobu rozvoje eliminační techniky se ukazuje, že EVLS je vhodným nástrojem nejen pro sledování mechanismu elektrodových procesů [10,11], ale i pro kvalitativní i kvantitativní analýzu zkoumaných roztoků [6-10]. Potvrzuje se, že pro adsorbovanou elektroaktivní částici specifický tvar EVLS signálu v podobě píku-protipíku (p-cp) poskytuje: (i) separaci potenciálově blízkých signálů (DE< 30 mV), (ii) stanovení více složek v analytu, (iii) odečet velikosti signálu bez korekce na základní linii (base-line correction), (iv) snížení detekčního limitu o jeden až dva řády a (v) zhodnocení elektrodového děje z hlediska předřazené chemické reakce. Předložená práce ukázala, že kombinace dvou technik, adsorptivního strippingu a eliminace je slibným nástrojem pro elektroanalýzu krátkých oligonukleotidů s rozdílnou sekvencí bází.
Abstract (in English)
aplication of elimination voltammetry to the resolution of adenine and cytosine reduction signals in hetero-deoxyoligonucleotides
Links
MSM0021622412, plan (intention)Name: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Acronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Interactions among the chemicals, environment and biological systems and their consequences on the global, regional and local scales (INCHEMBIOL)
PrintDisplayed: 8/5/2024 14:31