Atlas tvoří 80 obrazových tabulí, na nichž je zobrazeno 108 druhů mihulí a ryb, 21 druhů obojživelníků a 19 druhů plazů, vyskytujících se na území České a Slovenské republiky včetně druhů vymizelých, introdukovaných nebo zavlečených. K jednotlivým skupinám je uvedena stručná charakteristika, morfologický popis, způsob života a systém. Naproti obrazovým tabulím je umístěn text k zobrazeným druhům, který obsahuje základní údaje o rozšíření a výskytu, morfologický popis, poznámky o způsobu života a o významu z hlediska stupně ohrožení a právní ochrany. Připojen je systematický přehled, literatura a rejstřík.