EYER, Luděk, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jan PREISLER, Lenka HERNYCHOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága. In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita. s. 62. ISBN 80-210-3942-6. 2006.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága
Název anglicky Proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage
Autoři EYER, Luděk (203 Česká republika), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika), Hana KONEČNÁ (203 Česká republika), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika), Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika), Jan PREISLER (203 Česká republika), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Česká republika) a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika, garant).
Vydání Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 62-62, 2006.
Nakladatel Masarykova univerzita
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/06:00015615
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 80-210-3942-6
Klíčová slova anglicky Staphylococcus aureus; bacteriophages; therapy; proteome; MALDI MS
Štítky bacteriophages, MALDI MS, proteome, Staphylococcus aureus, THERAPY
Změnil Změnil: prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D., učo 45329. Změněno: 8. 4. 2010 10:13.
Anotace
Bakteriofág 812 je virulentní a polyvalentní fág, zástupce čeledi Myoviridae, který se vyznačuje širokým rozmezím hostitele zahrnujícím řadu druhů rodu Staphylococcus. Jeho genom je tvořen lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti cca 145 kbp, která vykazuje vysoký stupeň sekvenční homologie s genomy fágů K a G1. Polyvalentní stafylokokové bakteriofágy se v posledních letech staly předmětem zájmu s ohledem na jejich možné praktické využití při fágové terapii, která představuje vhodnou alternativu antibiotikové léčby stafylokokových infekcí. Cílem práce je detailní charakterizace proteomu fága 812 a identifikace proteinů tvořících fágové viriony. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány a k jejich separaci byla použita 1-D a 2-D PAGE. Proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI TOF MS a LC MS/MS. Pomocí 1-D PAGE bylo nalezeno cca 40 pruhů v rozmezí 10 150 kDa. Pomocí 2-D PAGE bylo nalezeno cca 120 skvrn (gely barvené CBB) a cca 700 skrvn (gely barvené stříbrem). Peptidovým mapováním bylo identifikováno celkem 24 proteinů fága 812. Použití 2D-PAGE umožnilo identifikovat 20 nových proteinů, které dosud nebyly určeny při analýze proteomu blízce příbuzných stafylokokových fágů K a G1. 15 proteinů bylo jednoznačně přiřazeno ke genům náležejícím do strukturního genomového modulu, zbývajících 9 je kódováno geny levého nebo pravého ramena fágového genomu. Mezi nejvíce abundantní proteiny fága 812 patří hlavní kapsidový protein, hlavní protein bičíkové pochvy a dále ORF8 a protein identický s ORF 95 fága K. Protein bičíkové pochvy se vyskytuje ve dvou formách lišících se elektroforetickou mobilitou. Předpokládá se, že tyto změny ve struktuře proteinu souvisejí s kontrakcí fágového bičíku. Identifikované proteiny fága 812 tvoří základ pro detailní analýzu struktury fágových virionů a jsou předpokladem jejich účinného a bezpečného využití ve fágové terapii.
Anotace anglicky
In this study, proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage is characterized in detail
Návaznosti
GA203/03/0515, projekt VaVNázev: Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 28. 3. 2024 15:18