Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{627905,
author = {Eyer, Luděk and Zdráhal, Zbyněk and Konečná, Hana and Pantůček, Roman and Růžičková, Vladislava and Preisler, Jan and Hernychová, Lenka and Doškař, Jiří},
address = {Brno},
booktitle = {X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů},
keywords = {Staphylococcus aureus; bacteriophages; therapy; proteome; MALDI MS},
language = {cze},
location = {Brno},
isbn = {80-210-3942-6},
pages = {62-62},
publisher = {Masarykova univerzita},
title = {Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága},
url = {http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani10/index.htm},
year = {2006}
}
TY - JOUR
ID - 627905
AU - Eyer, Luděk - Zdráhal, Zbyněk - Konečná, Hana - Pantůček, Roman - Růžičková, Vladislava - Preisler, Jan - Hernychová, Lenka - Doškař, Jiří
PY - 2006
TI - Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága
PB - Masarykova univerzita
CY - Brno
SN - 8021039426
KW - Staphylococcus aureus
KW - bacteriophages
KW - therapy
KW - proteome
KW - MALDI MS
UR - http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani10/index.htm
N2 - Bakteriofág 812 je virulentní a polyvalentní fág, zástupce čeledi Myoviridae, který se vyznačuje širokým rozmezím hostitele zahrnujícím řadu druhů rodu Staphylococcus. Jeho genom je tvořen lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti cca 145 kbp, která vykazuje vysoký stupeň sekvenční homologie s genomy fágů K a G1. Polyvalentní stafylokokové bakteriofágy se v posledních letech staly předmětem zájmu s ohledem na jejich možné praktické využití při fágové terapii, která představuje vhodnou alternativu antibiotikové léčby stafylokokových infekcí. Cílem práce je detailní charakterizace proteomu fága 812 a identifikace proteinů tvořících fágové viriony. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány a k jejich separaci byla použita 1-D a 2-D PAGE. Proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI TOF MS a LC MS/MS. Pomocí 1-D PAGE bylo nalezeno cca 40 pruhů v rozmezí 10 150 kDa. Pomocí 2-D PAGE bylo nalezeno cca 120 skvrn (gely barvené CBB) a cca 700 skrvn (gely barvené stříbrem). Peptidovým mapováním bylo identifikováno celkem 24 proteinů fága 812. Použití 2D-PAGE umožnilo identifikovat 20 nových proteinů, které dosud nebyly určeny při analýze proteomu blízce příbuzných stafylokokových fágů K a G1. 15 proteinů bylo jednoznačně přiřazeno ke genům náležejícím do strukturního genomového modulu, zbývajících 9 je kódováno geny levého nebo pravého ramena fágového genomu. Mezi nejvíce abundantní proteiny fága 812 patří hlavní kapsidový protein, hlavní protein bičíkové pochvy a dále ORF8 a protein identický s ORF 95 fága K. Protein bičíkové pochvy se vyskytuje ve dvou formách lišících se elektroforetickou mobilitou. Předpokládá se, že tyto změny ve struktuře proteinu souvisejí s kontrakcí fágového bičíku. Identifikované proteiny fága 812 tvoří základ pro detailní analýzu struktury fágových virionů a jsou předpokladem jejich účinného a bezpečného využití ve fágové terapii.
ER -
EYER, Luděk, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jan PREISLER, Lenka HERNYCHOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága (Proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage). In \textit{X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů}. Brno: Masarykova univerzita, 2006, p.~62. ISBN~80-210-3942-6.
|
