Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách.

VAŘECHA, Miroslav, Jana AMRICHOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Michal KOZUBEK and Stanislav KOZUBEK. Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách. (Analysis of localization and interaction of fluorescently labeled molecules in living and fixed human cell lines.). In Sborník konference Mikroskopie 2006. 2006.

Basic information

• Original name: Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách.
• Name (in English): Analysis of localization and interaction of fluorescently labeled molecules in living and fixed human cell lines.
• Authors: VAŘECHA, Miroslav (203 Czech Republic, guarantor), Jana AMRICHOVÁ (203 Czech Republic), Michal ZIMMERMANN (203 Czech Republic), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic) and Stanislav KOZUBEK (203 Czech Republic).
• Edition: Sborník konference Mikroskopie 2006, 2006.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14330/06:00024118
• Organization unit: Faculty of Informatics
• Keywords in English: living cells; GFP; fluorescent protein; fluorescent microscopy
• Tags: fluorescent microscopy, fluorescent protein, GFP, living cells
• Tags: International impact, Reviewed

Abstract

Pro analýzu lokalizace fluorescenčních molekul z obrazových dat nasnímaných na fixovaných i živých buňkách byly zavedeny nové metody analýzy vhodné pro 2D, 3D i 4D data, které se využili ke sledování translokace některých proteinů z mitochondrie do jádra buňky během apoptotického procesu. Z výsledků je zřejmé, že jsme obdrželi jak u fixovaných tak u živých buněk v první půlhodině po iniciaci apoptózy výraznou translokaci proteinů endonukleázi G i AIF do jádra buňky. Pro detekci vzájemné interakce sledovaných molekul se zavedla metoda FRET. Námi zavedená analýza dat získaných metodou FRET se provádí z 2D, 3D nebo i 4D dat. První výsledky ukazují na pozitivní interakci mezi AIF a endonukleázou G pozorováno ve fixovaných lidských buňkách.

Abstract (in English)

We introduced an analysis of localization and interaction of fluorescently labeled molecules in image data in 4D in living and fixed human cell lines. We observed the translocation of apoptotic proteins from mitochondria to cell nucleus.

Links

• GA202/04/0907, research and development project: Name: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

Investor: Czech Science Foundation, High-resolution cytometry of living cells

• GP204/03/D031, research and development project: Name: Apoptózu vyvolávající faktor (AIF): Jeho uvolnění z mitochondrie a změny, které vyvolává ve struktuře jaderného chromatinu

Investor: Czech Science Foundation, Apoptosis-inducing factor (AIF): its translocation from mitochondria and its action on nuclear chromatin

• GP204/05/P090, research and development project: Name: Topografická a funkční charakteristika telomer v různých typech nádorových buněk stanovená in situ a in vivo

Investor: Czech Science Foundation, Topographic and functional characterization of telomeres in various tumor cell lines determined in situ and in vivo

• IAA1065203, research and development project: Name: Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, The use of combination of laser microbeam and cytometric techniques in the study of the structure and dynamics of human genome

• MSM0021622419, plan (intention): Name: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Highly Parallel and Distributed Computing Systems