Detailed Information on Publication Record
2006
Optimalizace izolace bakteriální DNA amplifikovatelné v PCR
NĚMCOVÁ, Petra, Alena ŠPANOVÁ, Bohuslav RITTICH and Daniel HORÁKBasic information
Original name
Optimalizace izolace bakteriální DNA amplifikovatelné v PCR
Name (in English)
Optimization of the method of PCR-ready DNA izolation
Authors
NĚMCOVÁ, Petra (203 Czech Republic), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic), Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic, guarantor) and Daniel HORÁK (203 Czech Republic)
Edition
Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 105-105, 1 pp. 2006
Publisher
Masarykova univerzita
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/06:00015625
Organization unit
Faculty of Science
ISBN
80-210-3942-6
Keywords in English
DNA; magnetic particles; Lactobacillus; PCR
Tags
Změněno: 19/12/2006 15:31, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
Byl optimalizován postup izolace bakteriální DNA pomocí magnetických částic P(HEMA-co-GMA) (1/1) pokrytých karboxylovými skupinami (0,764 mM COOH/g ). Jako kontrola byly použity magnetické částice silikagelu (CPG, USA). Adsorpce DNA probíhala v prostředí vysoké koncentrace PEG 6000 a NaCl. K testování byla použita DNA izolovaná z bakterií rodu Lactobacillus narostlých v čisté kultuře. Při eluci DNA z částic bylo ověřováno použití různých pufrů (voda, TE, TBE a TAE pufr), doby eluce a způsobů promíchávání částic. Nejvhodnější postup byl použit při izolaci DNA z bakterií rodu Lactobacillus obsažených v mléčných výrobcích. Bakterie rodu Lactobacillus byly identifikovány pomocí PCR s rodově specifickými primery LbLMA 1-rev a R16-1 (Dubernet a spol., 2002). Druh Lactobacillus acidophilus byl identifikován pomocí PCR s druhově specifickými primery Aci I a Aci II (Tilsala a kol., 1997).
In English
The procedure was optimalised for the solid-phase bacterial DNA isolation using magnetic particles P(HEMA-co-EDMA) (1/1)covered by carboxyl groups (0,764 mM COOH/g). Magnetic silica particles (CPG, USA) were used as control. DNA adsorption was carried out in high PEG and NaCl concentrations. DNA isolated from pure cultures of bacteria of genus Lactobacillus was used. DNA elution was tested using different buffers (TE, TBE, TAE, water) and time durations including different intensity of sample mixing. The most suitable procedure was used for DNA isolation from bacteria of genus Lactobacillus in dairy products. Bacteria of genus Lactobacillus were identified using PCR with genus specific primers LbLMA 1-rev and R16-1 (Duberbet et al., 2002). The species Lactobacillus acidophilus was identified using PCR with species specific primers AciI and AciII (Tilsala et al. 1997).
Links
| GA203/05/2256, research and development project |
| ||
| MSM0021622415, plan (intention) |
| ||
| 1G57037, research and development project |
|