KOLOUCHOVÁ, Tereza, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL and Jiřina RELICHOVÁ. DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana (Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation). In X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2006. ISBN 80-210-3942-6.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
Name in Czech DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
Name (in English) Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation
Authors KOLOUCHOVÁ, Tereza (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana ŘEPKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Pavel LÍZAL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution).
Edition X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2006.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Conference abstract
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00016656
Organization unit Faculty of Science
ISBN 80-210-3942-6
Keywords in English Arabidopsis; mapping; mutation; gene identification
Tags Arabidopsis, gene identification, mapping, Mutation
Changed by Changed by: Mgr. Tereza Dobisová, Ph.D., učo 77899. Changed: 11/4/2011 18:23.
Abstract
V posledních patnácti letech bylo úsilí biologů zaměřeno na studium a porozumění molekulární podstaty vývojových procesů rostlin a na identifikaci a charakterizaci nových genů. V této oblasti hrála Arabidopsis thaliana důležitou úlohu jako nejvýznamnější rostlinný modelový organismus. Je to první rostlinný druh, jehož genom byl osekvencován, ale znalosti o funkcích jednotlivých genů jsou dosud malé. Rozvíjí se nové metody mutageneze a molekulárně genetické strategie pro charakterizaci mutací a izolaci genů. Cílem naší studie byla charakterizace mutace lycopodioformis (ly) vytvořené na genetickém pozadí S96 chemomutagenem ethylmetansulfonát v laboratoři Molekulární genetiky rostlin MU v Brně a identifikace genu prostřednictvím lokalizace mutantní alely do genetické mapy Arabidopsis thaliana. Mutace ly je vývojová mutace, pro kterou je charakteristický zakrslý vzrůst, rané kvetení, okoličnaté květenství. Mutace ly je determinována jedním genem; jedná se o recesivní mutaci štěpící v poměru 3:1. Mutantní alela ly byla lokalizována do genetické mapy prostřednictvím rekombinační analýzy v generaci F2 a DNA markerů SSR (simple sequence repeat), CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) a AFLP (amplified fragment length polymorphism). Mutace byla lokalizována na začátek chromozomu 5 ve vazbě s markery CIW15, MUK11D (3,9 cM) a nga 225 (5,2 cM). Na dlouhém rameni chromozomu 1 byla zachycena vazba mutace ly s markerem T27K12-SP6 (10,8 cM). Z dostupných databází byly vytipovány kandidátní geny SDR1 (celý název genu) na chromozomu 1, RTM2, SDR a TFL1 na chromozomu 5. Gen na chromozomu 1 pravděpodobně modifikuje funkci genu lokalizovaného na chromozomu 5.
Abstract (in English)
The aim of the work was the characterization of lycopodioformis mutation and candidate gene detection by fine genetic mapping.
Links
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
PrintDisplayed: 23/8/2024 20:23