DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u
Arabidopsis thaliana

a 2006

DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana

KOLOUCHOVÁ, Tereza, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL and Jiřina RELICHOVÁ

Basic information

Original name

DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana

Name in Czech

DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana

Name (in English)

Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation

Authors

KOLOUCHOVÁ, Tereza (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana ŘEPKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Pavel LÍZAL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution)

Edition

X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2006

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00016656

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-210-3942-6

Keywords in English

Arabidopsis; mapping; mutation; gene identification

Abstract

ORIG EN

V originále

V posledních patnácti letech bylo úsilí biologů zaměřeno na studium a porozumění molekulární podstaty vývojových procesů rostlin a na identifikaci a charakterizaci nových genů. V této oblasti hrála Arabidopsis thaliana důležitou úlohu jako nejvýznamnější rostlinný modelový organismus. Je to první rostlinný druh, jehož genom byl osekvencován, ale znalosti o funkcích jednotlivých genů jsou dosud malé. Rozvíjí se nové metody mutageneze a molekulárně genetické strategie pro charakterizaci mutací a izolaci genů. Cílem naší studie byla charakterizace mutace lycopodioformis (ly) vytvořené na genetickém pozadí S96 chemomutagenem ethylmetansulfonát v laboratoři Molekulární genetiky rostlin MU v Brně a identifikace genu prostřednictvím lokalizace mutantní alely do genetické mapy Arabidopsis thaliana. Mutace ly je vývojová mutace, pro kterou je charakteristický zakrslý vzrůst, rané kvetení, okoličnaté květenství. Mutace ly je determinována jedním genem; jedná se o recesivní mutaci štěpící v poměru 3:1. Mutantní alela ly byla lokalizována do genetické mapy prostřednictvím rekombinační analýzy v generaci F2 a DNA markerů SSR (simple sequence repeat), CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) a AFLP (amplified fragment length polymorphism). Mutace byla lokalizována na začátek chromozomu 5 ve vazbě s markery CIW15, MUK11D (3,9 cM) a nga 225 (5,2 cM). Na dlouhém rameni chromozomu 1 byla zachycena vazba mutace ly s markerem T27K12-SP6 (10,8 cM). Z dostupných databází byly vytipovány kandidátní geny SDR1 (celý název genu) na chromozomu 1, RTM2, SDR a TFL1 na chromozomu 5. Gen na chromozomu 1 pravděpodobně modifikuje funkci genu lokalizovaného na chromozomu 5.

In English

The aim of the work was the characterization of lycopodioformis mutation and candidate gene detection by fine genetic mapping.

Links

MSM0021622415, plan (intention)

Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

Citovat

KOLOUCHOVÁ, Tereza, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL and Jiřina RELICHOVÁ. DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana (Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation). In X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2006. ISBN 80-210-3942-6.

@proceedings{630391,
   author = {Kolouchová, Tereza and Řepková, Jana and Lízal, Pavel and Relichová, Jiřina},
   booktitle = {X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů.},
   keywords = {Arabidopsis; mapping; mutation; gene identification},
   language = {cze},
   isbn = {80-210-3942-6},
   title = {DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana},
   year = {2006}
}

TY  - CONF
ID  - 630391
AU  - Kolouchová, Tereza - Řepková, Jana - Lízal, Pavel - Relichová, Jiřina
PY  - 2006
TI  - DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana
SN  - 8021039426
KW  - Arabidopsis
KW  - mapping
KW  - mutation
KW  - gene identification
N2  - V posledních patnácti letech bylo úsilí biologů zaměřeno na studium a porozumění molekulární podstaty vývojových procesů rostlin a na identifikaci a charakterizaci nových genů. V této oblasti hrála Arabidopsis thaliana důležitou úlohu jako nejvýznamnější rostlinný modelový organismus. Je to první rostlinný druh, jehož genom byl osekvencován, ale znalosti o funkcích jednotlivých genů jsou dosud malé. Rozvíjí se nové metody mutageneze a molekulárně genetické strategie pro charakterizaci mutací a izolaci genů. Cílem naší studie byla charakterizace mutace lycopodioformis (ly) vytvořené na genetickém pozadí S96 chemomutagenem ethylmetansulfonát v laboratoři Molekulární genetiky rostlin MU v Brně a identifikace genu prostřednictvím lokalizace mutantní alely do genetické mapy Arabidopsis thaliana. Mutace ly je vývojová mutace, pro kterou je charakteristický zakrslý vzrůst, rané kvetení, okoličnaté květenství. Mutace ly je determinována jedním genem; jedná se o recesivní mutaci štěpící v poměru 3:1. Mutantní alela ly byla lokalizována do genetické mapy prostřednictvím rekombinační analýzy v generaci F2 a DNA markerů SSR (simple sequence repeat), CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) a AFLP (amplified fragment length polymorphism). Mutace byla lokalizována na začátek chromozomu 5 ve vazbě s markery CIW15, MUK11D (3,9 cM) a nga 225 (5,2 cM). Na dlouhém rameni chromozomu 1 byla zachycena vazba mutace ly s markerem T27K12-SP6 (10,8 cM). Z dostupných databází byly vytipovány kandidátní geny SDR1 (celý název genu) na chromozomu 1, RTM2, SDR a TFL1 na chromozomu 5. Gen na chromozomu 1 pravděpodobně modifikuje funkci genu lokalizovaného na chromozomu 5.
ER  -

KOLOUCHOVÁ, Tereza, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL and Jiřina RELICHOVÁ. DETEKCE GENU PROSTŘEDNICTVÍM MUTACE LYCOPODIOFORMIS u Arabidopsis thaliana (Gene detection in Arabidopsis thaliana by means of lycopodioformis mutation). In \textit{X. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů.}. 2006. ISBN~80-210-3942-6.

Detailed Information on Publication Record