D 2006

Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů

MIKELOVÁ, Radka, Libuše TRNKOVÁ, František JELEN and Roland ROZIK

Basic information

Original name

Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů

Name in Czech

Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů

Name (in English)

Influence of pH and accumulation time on electrochemical behavior of short hetero-oligonucleotides

Authors

MIKELOVÁ, Radka (203 Czech Republic), Libuše TRNKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor), František JELEN (203 Czech Republic) and Roland ROZIK (703 Slovakia)

Edition

První. Praha, XXVI. Moderní elektrochemické metody, p. 57-61, 154 pp. 2006

Publisher

Česká společnost chemická

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10405 Electrochemistry

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00015333

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-86238-98-9

Keywords in English

Electrochemistry; Hetero-oligonucleotides; Mercury electrode; Elimination voltammetry with linear scan;
Změněno: 2/6/2006 09:47, Mgr. Roland Rozik, Ph.D.

Abstract

V originále

Nedávno byla eliminační voltametrie s lineární polarizací (EVLS Elimination Voltammetry with Linear Scan) úspěšně použita k analýze voltametrických dat krátkých syntetických oligodeoxynukleotidů (ODNs), které obsahovaly redukovatelné báze: adenin (A) a cytosin (C). V případě homo-ODNs se jednalo o devítimery dA9 a dC9 a jejich směsi, v případě hetero-ODNs o devítimery se stejným poměrem (C/A=3/1), ale s rozdílnou sekvencí bází. Redukční procesy obou bází jsou si na rtuťové elektrodě potenciálově velmi blízké, odpovídající píky C a A se překrývají a běžné voltametrické metody nám dovolují na svých záznamech pozorovat pouze jejich jediný signál. Jedině EVLS byla schopná tyto dva překrývající se signály rozdělit a registrovat. Jelikož se detekce a separace píků C a A podstatně zvýší díky adsorpci, byla EVLS kombinována s adsorptivním nahromaděním elektroaktivní částice na povrchu elektrody AdS EVLS. Bylo zjištěno, že voltametrické signály jsou velmi závislé na pH a na době akumulace. Naše práce se zaměřila na studium vlivu těchto dvou parametrů na AdS EVLS signály výše zmíněných hetero-ODNs. Závěr V práci byla předložena detekční metoda ODNs založená na spojení dvou procedur, adsorpční rozpouštěcí voltametrie (AdSV - Adsorptive Stripping Voltammetry) a eliminační voltametrie s lineární polarizací elektrody (EVLS - Elimination Voltammetry with Linear Scan). Bylo ukázáno, že AdS EVLS dovede nejen kvantifikovat daný ODN pomocí poměru A/C, ale i kvalitativně rozlišit změny v primární struktuře nukleotidů v ODN řetězci a pravděpodobně i v následných změnách sekundární a terciární struktury ODNs . Dokonce se dá očekávat, že v případě identického počtu bází bude tento nový nástroj schopen rozlišit spolu sousedící či nesousedící sledované báze. AdS EVLS lze považovat jako nový nástroj pro kvalitativní a kvantitativní analýzu ODNs.

In English

Influence of pH and accumulation time on electrochemical behavior of short hetero-oligonucleotides

Links

IAA100040602, research and development project
Name: Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, New approaches in electrochemical analysis of nucleic acids and oligonucleotides aimed at a ultrasensitive microdetection of DNA and DNA hybridization
LC06035, research and development project
Name: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine
MSM0021622412, plan (intention)
Name: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Acronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Interactions among the chemicals, environment and biological systems and their consequences on the global, regional and local scales (INCHEMBIOL)