MIKELOVÁ, Radka, Libuše TRNKOVÁ, František JELEN and Roland ROZIK. Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů (Influence of pH and accumulation time on electrochemical behavior of short hetero-oligonucleotides). In XXVI. Moderní elektrochemické metody. První. Praha: Česká společnost chemická, 2006, p. 57-61, 154 pp. ISBN 80-86238-98-9.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů
Name in Czech Vliv pH a doby akumulace na elektrochemické chování krátkých hetero-oligonukleotidů
Name (in English) Influence of pH and accumulation time on electrochemical behavior of short hetero-oligonucleotides
Authors MIKELOVÁ, Radka (203 Czech Republic), Libuše TRNKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor), František JELEN (203 Czech Republic) and Roland ROZIK (703 Slovakia).
Edition První. Praha, XXVI. Moderní elektrochemické metody, p. 57-61, 154 pp. 2006.
Publisher Česká společnost chemická
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10405 Electrochemistry
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00015333
Organization unit Faculty of Science
ISBN 80-86238-98-9
Keywords in English Electrochemistry; Hetero-oligonucleotides; Mercury electrode; Elimination voltammetry with linear scan;
Tags electrochemistry, Hetero-oligonucleotides, Mercury Electrode
Changed by Changed by: Mgr. Roland Rozik, Ph.D., učo 108478. Changed: 2/6/2006 09:47.
Abstract
Nedávno byla eliminační voltametrie s lineární polarizací (EVLS Elimination Voltammetry with Linear Scan) úspěšně použita k analýze voltametrických dat krátkých syntetických oligodeoxynukleotidů (ODNs), které obsahovaly redukovatelné báze: adenin (A) a cytosin (C). V případě homo-ODNs se jednalo o devítimery dA9 a dC9 a jejich směsi, v případě hetero-ODNs o devítimery se stejným poměrem (C/A=3/1), ale s rozdílnou sekvencí bází. Redukční procesy obou bází jsou si na rtuťové elektrodě potenciálově velmi blízké, odpovídající píky C a A se překrývají a běžné voltametrické metody nám dovolují na svých záznamech pozorovat pouze jejich jediný signál. Jedině EVLS byla schopná tyto dva překrývající se signály rozdělit a registrovat. Jelikož se detekce a separace píků C a A podstatně zvýší díky adsorpci, byla EVLS kombinována s adsorptivním nahromaděním elektroaktivní částice na povrchu elektrody AdS EVLS. Bylo zjištěno, že voltametrické signály jsou velmi závislé na pH a na době akumulace. Naše práce se zaměřila na studium vlivu těchto dvou parametrů na AdS EVLS signály výše zmíněných hetero-ODNs. Závěr V práci byla předložena detekční metoda ODNs založená na spojení dvou procedur, adsorpční rozpouštěcí voltametrie (AdSV - Adsorptive Stripping Voltammetry) a eliminační voltametrie s lineární polarizací elektrody (EVLS - Elimination Voltammetry with Linear Scan). Bylo ukázáno, že AdS EVLS dovede nejen kvantifikovat daný ODN pomocí poměru A/C, ale i kvalitativně rozlišit změny v primární struktuře nukleotidů v ODN řetězci a pravděpodobně i v následných změnách sekundární a terciární struktury ODNs . Dokonce se dá očekávat, že v případě identického počtu bází bude tento nový nástroj schopen rozlišit spolu sousedící či nesousedící sledované báze. AdS EVLS lze považovat jako nový nástroj pro kvalitativní a kvantitativní analýzu ODNs.
Abstract (in English)
Influence of pH and accumulation time on electrochemical behavior of short hetero-oligonucleotides
Links
IAA100040602, research and development projectName: Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, New approaches in electrochemical analysis of nucleic acids and oligonucleotides aimed at a ultrasensitive microdetection of DNA and DNA hybridization
LC06035, research and development projectName: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine
MSM0021622412, plan (intention)Name: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Acronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Interactions among the chemicals, environment and biological systems and their consequences on the global, regional and local scales (INCHEMBIOL)
PrintDisplayed: 19/7/2024 11:17