J 2006

Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets

ECKSTEIN, R. L., R. A. O'NEIL, Jiří DANIHELKA, A. OTTE, W. KÖHLER et. al.

Basic information

Original name

Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets

Name in Czech

Genetická struktura periferních a centrálních populací tří ohrožených druhů nivních violek

Authors

ECKSTEIN, R. L. (276 Germany), R. A. O'NEIL (276 Germany), Jiří DANIHELKA (203 Czech Republic, guarantor), A. OTTE (276 Germany) and W. KÖHLER (276 Germany)

Edition

Molecular Ecology, Blackwell Publishing Ltd. 2006, 0962-1083

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 4.825

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00017001

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000239010000006

Keywords in English

AFLP; conservation; genetic diversity; marginal populations; spatial genetic structure; Viola

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 18/12/2006 13:30, Ing. Jiří Danihelka, Ph.D.

Abstract

V originále

AFLP (4 primer combinations) was analysed in 950 individuals of 50 populations. Marginal populations were smaller and were more isolated in two species. Differentiation was stronger, genetic diversity and gene flow lower in marginal populations of the two more isolated species. Species-specific differences in genetic structure were related to effects of fragmentation. Variation between regions (3-6%), among (30-37%) and within populations (60-64%) was significant. Marginal populations lacked loci that were rare and localised in core populations. Loss of widespread loci in marginal Viola stagnina populations indicated genetic erosion. Autocorrelation within populations was statistically significant up to 10-20 m. Peripheral populations contributed significantly to genetic variation and contained unique loci, which made them important for the conservation of genetic diversity. There were no significant correlations between molecular variance and population size or isolation.

In Czech

AFLP (4 kombinace primerů) byl analyzován u 950 jedinců z 50 populací. U dvou druhů byly marginální populace izolovanější. Diferenciace byla větší, genetická diverzita a tok genů byly menší u periferních populací dvou izolovanějších druhů. Druhově specifické rozdíly v genetické struktuře byly spojeny s vlivem fragmentace. Variabilita mezi oblastmi (3-6%), mezi populacemi (30-37%) a uvnitř populací (60-64%) byla signifikantní. Okrajové populace postrádaly lokusy, které byly v jádrových populacích vzácné nebo se vyskytovaly jen omozeně. Ztrátu hojně rozšířených lokusů u marginálních populací druhu Viola stagnina lze vysvětlit genetickou erozí. Prostorová autokorelace uvnitř populací byla statisticky významná na vzdálenost do 10-20 m. Periferní populace význymně přispívají ke genetické proměnlivosti a obsahují unikátní lokusy, a proto jsou důležité pro ochranu genetické diverzity. Nebyla zjištěna signifikantní korelace mezi molekulární proměnlivostí a velikostí populace nebo mírou izolace.

Links

MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time