ECKSTEIN, R. L., R. A. O'NEIL, Jiří DANIHELKA, A. OTTE and W. KÖHLER. Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets. Molecular Ecology. Blackwell Publishing Ltd., 2006, vol. 15, No 9, p. 2367-2379. ISSN 0962-1083.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets
Name in Czech Genetická struktura periferních a centrálních populací tří ohrožených druhů nivních violek
Authors ECKSTEIN, R. L. (276 Germany), R. A. O'NEIL (276 Germany), Jiří DANIHELKA (203 Czech Republic, guarantor), A. OTTE (276 Germany) and W. KÖHLER (276 Germany).
Edition Molecular Ecology, Blackwell Publishing Ltd. 2006, 0962-1083.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 4.825
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00017001
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000239010000006
Keywords in English AFLP; conservation; genetic diversity; marginal populations; spatial genetic structure; Viola
Tags AFLP, conservation, genetic diversity, marginal populations, spatial genetic structure, Viola
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: Ing. Jiří Danihelka, Ph.D., učo 5926. Changed: 18/12/2006 13:30.
Abstract
AFLP (4 primer combinations) was analysed in 950 individuals of 50 populations. Marginal populations were smaller and were more isolated in two species. Differentiation was stronger, genetic diversity and gene flow lower in marginal populations of the two more isolated species. Species-specific differences in genetic structure were related to effects of fragmentation. Variation between regions (3-6%), among (30-37%) and within populations (60-64%) was significant. Marginal populations lacked loci that were rare and localised in core populations. Loss of widespread loci in marginal Viola stagnina populations indicated genetic erosion. Autocorrelation within populations was statistically significant up to 10-20 m. Peripheral populations contributed significantly to genetic variation and contained unique loci, which made them important for the conservation of genetic diversity. There were no significant correlations between molecular variance and population size or isolation.
Abstract (in Czech)
AFLP (4 kombinace primerů) byl analyzován u 950 jedinců z 50 populací. U dvou druhů byly marginální populace izolovanější. Diferenciace byla větší, genetická diverzita a tok genů byly menší u periferních populací dvou izolovanějších druhů. Druhově specifické rozdíly v genetické struktuře byly spojeny s vlivem fragmentace. Variabilita mezi oblastmi (3-6%), mezi populacemi (30-37%) a uvnitř populací (60-64%) byla signifikantní. Okrajové populace postrádaly lokusy, které byly v jádrových populacích vzácné nebo se vyskytovaly jen omozeně. Ztrátu hojně rozšířených lokusů u marginálních populací druhu Viola stagnina lze vysvětlit genetickou erozí. Prostorová autokorelace uvnitř populací byla statisticky významná na vzdálenost do 10-20 m. Periferní populace význymně přispívají ke genetické proměnlivosti a obsahují unikátní lokusy, a proto jsou důležité pro ochranu genetické diverzity. Nebyla zjištěna signifikantní korelace mezi molekulární proměnlivostí a velikostí populace nebo mírou izolace.
Links
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 28/8/2024 19:42