J 2006

Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei

ULMAN, Vladimír

Basic information

Original name

Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei

Name in Czech

Automatická detekce histonů u chromosomu X v obrazech buněčného jádra

Authors

ULMAN, Vladimír (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Clinician and Technology (Lékař a technika), Praha, Czech Medical Association J.E.Purkyne, 2006, 0301-5491

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14330/06:00015770

Organization unit

Faculty of Informatics

Keywords in English

image registration; voxel-based registration; top-hat filtering; image analysis

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 2/6/2010 16:27, RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.

Abstract

V originále

The description of computer method used for detection of histone particle in the small vicinity of chromosome X. The input data were 3D images of histones with nuclei and chromosomes with nuclei. Acquired on confocal optical microscope. The method was evaluated on real data. Compared to human expert, it gave the same result on 91% of 139 test cases.

In Czech

Popisuje počítačovou metodu použitou pro detekci histonových teček v blízkém okolí chromosomů X. Vstupní data byly 3D obrázky histonů s jádrem a chromosomů s jádrem. Pořízeno na konfokálním optickém mikroskopu. Metoda byla testována na reálných datech a dala v porovnání s lidským expertem stejný výsledek v 91% ze 139 testovaných případů.

Links

GP202/03/D033, research and development project
Name: Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
Investor: Czech Science Foundation, The efect of methylation and acetylation on chromatin structure
MSM0021622419, plan (intention)
Name: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Highly Parallel and Distributed Computing Systems