Detailed Information on Publication Record
2006
Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb
ŠMERDA, Jakub, Ivo SEDLÁČEK, Zdenka PÁČOVÁ, Eva KREJČÍ, Ladislav HAVEL et. al.Basic information
Original name
Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb
Name in Czech
Paenibacillus sepulcri sp. nov., izolovaný z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii
Authors
ŠMERDA, Jakub (203 Czech Republic, guarantor), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic), Zdenka PÁČOVÁ (203 Czech Republic), Eva KREJČÍ (203 Czech Republic) and Ladislav HAVEL (203 Czech Republic)
Edition
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK, Society for General Microbiology, 2006, 1466-5026
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
Impact factor
Impact factor: 2.662
RIV identification code
RIV/00216224:14310/06:00017383
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000241445700015
Keywords in English
Paenibacillus; DNA DNA hybridization; 16S rDNA; chemotaxonomy; phenotypic analysis
Změněno: 5/6/2007 08:54, Ing. Jakub Šmerda, Ph.D.
V originále
In 2001, a Gram-variable, facultatively anaerobic, endospore-forming bacterium isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb of the Roman necropolis of Carmona was deposited as Paenibacillus strain LMG 19508. Subsequently, the strain was characterized in detail using phenotypic and molecular methods. The 16S rRNA gene sequence confirmed that the strain belongs to the genus Paenibacillus and indicated its relationship to Paenibacillus mendelii CCM 4839T (96.7 % sequence similarity). The predominant menaquinone was MK-7. The cell wall contained meso-diaminopimelic acid of the A1 type. The DNA G+C content (50 mol%) and the major fatty acid (anteiso-C15 : 0) of strain LMG 19508T were also consistent with its affiliation to the genus Paenibacillus. DNA–DNA hybridization distinguished strain LMG 19508T from other phylogenetically related Paenibacillus species. Therefore, the isolate represents a novel species, for which the name Paenibacillus sepulcri sp. nov. is proposed. The type strain is CCM 7311T (=LMG 19508T).
In Czech
V roce 2001 byla izolována z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii gram-variabilní, fakultativně anaerobní bakterie, tvořící endospory. Tato bakterie byla uložena ve sbírce LMG pod názvem Paenibacillus sp. s katalogizačním číslem LMG 19508. Kmen byl následně charakterizován pomocí fenotypových a molekulárních metod. Sekvenace a následné porovnání sekvence 16S rRNA genu potvrdili, že kmen náleží do rodu Paenibacillus a odalili jeho blízký vztah k druhu Paenibacillus mendelii CCM 4839T (96,7% sekvenční podobnosti). Převládající menachinon byl typ MK-7. Buněčné stěny obsahovaly meso-diaminopimelovou kyselinu typu A1. Obsah G+C (50%mol) a převládající mastná kyselina kmene LMG 19508T byla v souladu s charakteristikami rodu Paenibacillus. Nicméně, DNA-DNA hybridizace odlišili kmen LMG 19508T od ostatních fylogeneticky příbuzných druhů. Usuzujeme, že izolát představuje nový druh - Paenibacillus sepulcri sp. nov. Typový kmen je kmen CCM 7311T (=LMG 19508T).
Links
| LC06073, research and development project |
| ||
| MSM0021622416, plan (intention) |
|