ŠMERDA, Jakub, Ivo SEDLÁČEK, Zdenka PÁČOVÁ, Eva KREJČÍ and Ladislav HAVEL. Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. UK: Society for General Microbiology, 2006, roč. 56, No 10, p. 2341-2344. ISSN 1466-5026.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb
Name in Czech Paenibacillus sepulcri sp. nov., izolovaný z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii
Authors ŠMERDA, Jakub (203 Czech Republic, guarantor), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic), Zdenka PÁČOVÁ (203 Czech Republic), Eva KREJČÍ (203 Czech Republic) and Ladislav HAVEL (203 Czech Republic).
Edition International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK, Society for General Microbiology, 2006, 1466-5026.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW Abstrakt
Impact factor Impact factor: 2.662
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00017383
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000241445700015
Keywords in English Paenibacillus; DNA DNA hybridization; 16S rDNA; chemotaxonomy; phenotypic analysis
Tags 16S rDNA, chemotaxonomy, DNA DNA hybridization, Paenibacillus, phenotypic analysis
Changed by Changed by: Ing. Jakub Šmerda, Ph.D., učo 133653. Changed: 5/6/2007 08:54.
Abstract
In 2001, a Gram-variable, facultatively anaerobic, endospore-forming bacterium isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb of the Roman necropolis of Carmona was deposited as Paenibacillus strain LMG 19508. Subsequently, the strain was characterized in detail using phenotypic and molecular methods. The 16S rRNA gene sequence confirmed that the strain belongs to the genus Paenibacillus and indicated its relationship to Paenibacillus mendelii CCM 4839T (96.7 % sequence similarity). The predominant menaquinone was MK-7. The cell wall contained meso-diaminopimelic acid of the A1 type. The DNA G+C content (50 mol%) and the major fatty acid (anteiso-C15 : 0) of strain LMG 19508T were also consistent with its affiliation to the genus Paenibacillus. DNA–DNA hybridization distinguished strain LMG 19508T from other phylogenetically related Paenibacillus species. Therefore, the isolate represents a novel species, for which the name Paenibacillus sepulcri sp. nov. is proposed. The type strain is CCM 7311T (=LMG 19508T).
Abstract (in Czech)
V roce 2001 byla izolována z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii gram-variabilní, fakultativně anaerobní bakterie, tvořící endospory. Tato bakterie byla uložena ve sbírce LMG pod názvem Paenibacillus sp. s katalogizačním číslem LMG 19508. Kmen byl následně charakterizován pomocí fenotypových a molekulárních metod. Sekvenace a následné porovnání sekvence 16S rRNA genu potvrdili, že kmen náleží do rodu Paenibacillus a odalili jeho blízký vztah k druhu Paenibacillus mendelii CCM 4839T (96,7% sekvenční podobnosti). Převládající menachinon byl typ MK-7. Buněčné stěny obsahovaly meso-diaminopimelovou kyselinu typu A1. Obsah G+C (50%mol) a převládající mastná kyselina kmene LMG 19508T byla v souladu s charakteristikami rodu Paenibacillus. Nicméně, DNA-DNA hybridizace odlišili kmen LMG 19508T od ostatních fylogeneticky příbuzných druhů. Usuzujeme, že izolát představuje nový druh - Paenibacillus sepulcri sp. nov. Typový kmen je kmen CCM 7311T (=LMG 19508T).
Links
LC06073, research and development projectName: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 30/9/2024 03:39