Vytvoření typologie tekoucích vod ČR je jedním ze základních metodických podkladů nutných pro naplňování cílů Rámcové směrnice 2000/60/EC (Water Framework Directive) z roku 2000 ustavující rámec pro činnost členů EU v oblasti vodní politiky. Tato směrnice je orientována na komplexní hodnocení ekologického stavu v rámci hydrologických celků (povodí) na základě příslušnosti hodnoceného vodního útvaru (lokality) k určitému typu. Zjištěný stav se porovnává se stavem referenčním, očekávaným pro tento útvar a to včetně zařazení do jedné z pěti tříd ekologického stavu: velmi dobrého, dobrého, středního, poškozeného, zničeného. V tomto příspěvku je předložen jako jeden z možných přístupů, návrh typologie založený na kombinaci biotické a abiotické klasifikace a také bottom up a top down přístupu. Biotická složka je představována makrozoobentosem, jsou použita data ze systému PERLA ze 300 referenčních lokalit a doplňkově data z jiných zdrojů. Abiotická data sestávají jednak z výsledků měření a analýz prováděných pro lokality systému PERLA, jednak z mapových podkladů převážně ve formě GIS (základní vohohosp. mapy, bioregiony, mapy krajinného pokryvu atd.). Pro hodnocení dat byly použity metody mnohorozměrné analýzy (např. aglomerativní a divizivní klasifikace, korespondenční analýza), strukturální funkční a indikátorové indexy. Výsledkem je vymezení typů toků reflektujících ve skladbě a struktuře bioty působení kombinací abiotických faktorů. Je podána charakteristika reprezentativně zastoupených typů v povodí Labe a v povodí Moravy a Odry.