Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů

BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie and Vladimír VAŠKŮ. Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů (New 3´-UTR mutation in Gfi-1 gene is associated with cutaneous T-cell lymphoma). In Sborník XXI. Sjezdu českých a slovenských alergologů a klinických imunologů, Brno, 2004, supp 2. Praha: Tigis, 2004, p. 58-58.

Basic information

• Original name: Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů
• Name (in English): New 3´-UTR mutation in Gfi-1 gene is associated with cutaneous T-cell lymphoma
• Authors: BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Julie (203 Czech Republic, guarantor) and Vladimír VAŠKŮ (203 Czech Republic).
• Edition: Praha, Sborník XXI. Sjezdu českých a slovenských alergologů a klinických imunologů, Brno, 2004, supp 2, p. 58-58, 1 pp. 2004.
• Publisher: Tigis

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/04:00021719
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: gene; Gfi-1; cutaneous T-cell lymphoma
• Tags: cutaneous T-cell lymphoma, gene, Gfi-1

Abstract

Úvod: Gfi-1 kóduje transkripční represorový onkoprotein, původně i dentifikovaný inzerční mutagenezou s užitím retrovirových vektorů v myších T-lymfomech. Cílem práce bylo asociovat nově objevený polymorfismus 1765 C->T s výskytem kožních T-lymfomů v české populaci. Materiál a metody: Heteroduplexní analýzou potvrzenou kapilární i radioizotovou sekvenací jsme prokázali nový, dosud nepublikovaný polymorfismus 1765 C->T ve 3 oblasti genu pro Gfi-1. Následně jsme vyvinuli PCR metodu s restrikční analýzou pomocí enzymu AvrII, která umožňuje rychlou detekci tohoto polymorfismu na širších klinických souborech. Srovnali jsme genotypové distribuce a alelické frekvence tohoto polymorfismu mezi skupinou 61 pacientů s kožními T-lymfomy a skupinou 93 zdravých jedinců podobné struktury věku a pohlaví. Výsledky: Neprokázali jsme signifikantní rozdíl v alelických frekvencích vyšetřeného polymorfismu 1765 CT mezi pacienty s kožním T-lymfomem (T= 36.9%) oproti kontrolním osobám (T=44.1%; p=0.209). Neprokázali jsme ani signifikantní rozdíl v distribuci genotypů mezi pacienty s T-lymfomy a kontrolními subjekty (p=0.227, tab. 1). Prokázali jsme však, že odds ratio (OR) pro genotyp TT u pacientů s kožním T-lymfomem je 0.510, 95% CI=0.22-1.14, p=0.07. Genotyp TT polymorfismu 1765 CT v Gfi-1 genu tedy představuje potenciálně protektivní variantu pro kožní T-lymfom. Závěr: Předpokládá se, že Gfi-1 působí jako dominantní onkogen, který kooperuje s Myc a Pim-1 v procesu vzniku lymfomů. U alelické varianty T 1765 C->T polymorfismu dochází k zániku vazebného místa pro aktivátorový protein 1 (AP-1) ve 3 oblasti. Je zajímavé, že homozygotní genotyp pro tuto alelickou variantu (TT) je zřejmě asociován s nižším OR pro kožní T-lymfom.

Abstract (in English)

Gfi-1 encodes transcriptional repressor oncoprotein identified by a retroviral insertion mutagenesis screen for tumor progression in mouse T-cell lymphoma lines. The aim of our study was to test the association of novel 1765 C/T polymorphism with CTCL in the Czech population. Materials and methods: We identified alteration in Gfi-1 non-coding 3- sequence that proved to be the 1765 C/T transition using heteroduplex analysis followed by capillary as well as radioisotopic sequencing. A simple PCR method with restriction analysis using AvrII enzyme was developed for the rapid and simple detection of this new polymorphism. The genotype distributions as well as allelic frequencies of the polymorphism were compared between 61 patients with CTCL and a group of 93 healthy individuals of similar age and gender distribution. Results: No significant difference in allelic frequencies of examined polymorphism 1765 C->T in patients with CTCL (T= 36.9) against the control subjects (T= 44.1) was proved (P=0.209). Similarly, no significant difference in the genotype distributions of the examined polymorphism between the patients with CTCL and the controls was found (p=0.227). However, the lower odds ratio for the TT genotype in CTCL patients compared to control subjects was observed (OR=0.546, 95% confidential interval=0.22-1.14, p=0.07). Discussion: The allelic variant T of 1765 C/T polymorphism is characterized by extinction of the binding site for AP-1 protein in 3 - region of Gfi-1 gene. The homozygote genotype TT seems to be associated with lower OR for CTCL. Therefore, the TT genotype of 1765 C->T polymorphism of Gfi-1 gene may have potentially protective effect against CTCL.

Links

• MSM 141100002, plan (intention): Name: Molekulární patofyziologie multigenních chorob

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular pathophysiology of multigene diseases