ŠMARDA, Petr. DNA ploidy levels and intraspecific DNA content variability in Romanian fescues (Festuca, Poaceae) measured in fresh and herbarium material. Folia Geobotanica. Průhonice: Institute of Botany, 2006, vol. 41, No 4, p. 417-432. ISSN 1211-9520.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name DNA ploidy levels and intraspecific DNA content variability in Romanian fescues (Festuca, Poaceae) measured in fresh and herbarium material
Name in Czech Stupeň ploidie a vnitrodruhová variabilita v obsahu DNA rumunských kostřav (Festuca, Poaceae) měřená u živého a herbářového materiálu
Authors ŠMARDA, Petr (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Folia Geobotanica, Průhonice, Institute of Botany, 2006, 1211-9520.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 1.196
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00015986
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000242230200005
Keywords in English Balkan Peninsula; Festuca ovina group; Festuca valesiaca group; Festuca sect. Eskia; Flow cytometry; Intraspecific genome size variability; Polyploidy
Tags Balkan peninsula, Festuca ovina group, Festuca sect. Eskia, Festuca valesiaca group, flow cytometry, intraspecific genome size variability, polyploidy
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: Mgr. Petr Šmarda, Ph.D., učo 21109. Changed: 2/2/2010 08:22.
Abstract
DNA ploidy level estimates of 11 species and two natural hybrids of Festuca sampled from 39 locations in Romania are presented. Altogether, 48 living samples (of which 22 one-year-old herbarium specimens were available), and additional 65 one-year-old herbarium specimens were analysed using flow cytometry with DAPI staining. The following DNA ploidy levels were assessed: F. callieri (4x), F. ovina (2x), F. pallens (2x), F. polesica (2x), F. pseudodalmatica (2x, 4x, 5x), F. pseudovaginata (2x), F. pseudovina (2x), F. pseudovina x F. rupicola (4x), F. rupicola (6x), F. vaginata (2x), F. vaginata x F. valesiaca (2x), F. valesiaca (2x) and F. xanthina (2x). Festuca pseudovaginata is reported for the flora of Romania for the first time. Measurements of one-year-old herbarium specimens produced significantly smaller sample/standard ratios (P<0.001) and higher coefficients of variance (P<0.001) when compared with fresh plant samples. Several species exhibited marked intraspecific DNA content variability, documented by non-overlapping double-peaks or bimodal peaks in simultaneous measurements. Maximum difference of about 9.2% in relative DNA content was observed in F. pallens, 5.5% in F. polesica, 4.2% in F. vaginata, and 3.8% in F. rupicola. Diploid F. xanhina (Festuca sect. Eskia Willk.) had 1.39–1.58 times higher monoploid relative DNA content in relation to the species of section Festuca.
Abstract (in Czech)
Pro 11 druhů a dva přírodní hybridy byl stanoveň stupeň ploidie. Vzorky pocházejí ze 39 lokalit v Rumunsku. Za pomoci flow cytometrie s DAPI barvením bylo celkem analyzováno 48 živých rostlin (u 22 rostlin byl také dostupný 1 rok starý herbářový materiál) a dalších 65 jeden rok starých herbářových položek. Zjištěny byly následující ploidní úrovně: F. callieri (4x), F. ovina (2x), F. pallens (2x), F. polesica (2x), F. pseudodalmatica (2x, 4x, 5x), F. pseudovaginata (2x), F. pseudovina (2x), F. pseudovina x F. rupicola (4x), F. rupicola (6x), F. vaginata (2x), F. vaginata x F. valesiaca (2x), F. valesiaca (2x) and F. xanthina (2x). Festuca pseudovaginata je dokumentována pro rumunskou flóru poprvé. Ve srovnání se živými vzorky měření z herbářových položek vykazovalo významě menší poměr ke standardu (P<0.001) a horší koeficienty variance píků (P<0.001). Několik druhů vykazovalo výraznou vnitrodruhovou variabilitu v obsahu DNA, která byla dokumentována při současném měření vzorků jako bimodální píky nebo dvojpíky. Maximální rozdíl byl 9.2% v relativním obsahu F. pallens, 5.5% u F. polesica, 4.2% u F. vaginata a 3.8% u F. rupicola. Diploidní F. xanhina (Festuca sect. Eskia Willk.) měla monoploidní obsah DNA 1.39–1.58-krát větší ve srovnání s druhy sekce Festuca.
Links
GA206/03/0228, research and development projectName: Fylogeografie polyploidních komplexů v Evropě
Investor: Czech Science Foundation, Phylogeography of polyploid complexes in Europe
LC06073, research and development projectName: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 30/4/2024 23:18