J 2006

DNA ploidy levels and intraspecific DNA content variability in Romanian fescues (Festuca, Poaceae) measured in fresh and herbarium material

ŠMARDA, Petr

Basic information

Original name

DNA ploidy levels and intraspecific DNA content variability in Romanian fescues (Festuca, Poaceae) measured in fresh and herbarium material

Name in Czech

Stupeň ploidie a vnitrodruhová variabilita v obsahu DNA rumunských kostřav (Festuca, Poaceae) měřená u živého a herbářového materiálu

Authors

ŠMARDA, Petr (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Folia Geobotanica, Průhonice, Institute of Botany, 2006, 1211-9520

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 1.196

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00015986

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000242230200005

Keywords in English

Balkan Peninsula; Festuca ovina group; Festuca valesiaca group; Festuca sect. Eskia; Flow cytometry; Intraspecific genome size variability; Polyploidy

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 2/2/2010 08:22, Mgr. Petr Šmarda, Ph.D.

Abstract

V originále

DNA ploidy level estimates of 11 species and two natural hybrids of Festuca sampled from 39 locations in Romania are presented. Altogether, 48 living samples (of which 22 one-year-old herbarium specimens were available), and additional 65 one-year-old herbarium specimens were analysed using flow cytometry with DAPI staining. The following DNA ploidy levels were assessed: F. callieri (4x), F. ovina (2x), F. pallens (2x), F. polesica (2x), F. pseudodalmatica (2x, 4x, 5x), F. pseudovaginata (2x), F. pseudovina (2x), F. pseudovina x F. rupicola (4x), F. rupicola (6x), F. vaginata (2x), F. vaginata x F. valesiaca (2x), F. valesiaca (2x) and F. xanthina (2x). Festuca pseudovaginata is reported for the flora of Romania for the first time. Measurements of one-year-old herbarium specimens produced significantly smaller sample/standard ratios (P<0.001) and higher coefficients of variance (P<0.001) when compared with fresh plant samples. Several species exhibited marked intraspecific DNA content variability, documented by non-overlapping double-peaks or bimodal peaks in simultaneous measurements. Maximum difference of about 9.2% in relative DNA content was observed in F. pallens, 5.5% in F. polesica, 4.2% in F. vaginata, and 3.8% in F. rupicola. Diploid F. xanhina (Festuca sect. Eskia Willk.) had 1.39–1.58 times higher monoploid relative DNA content in relation to the species of section Festuca.

In Czech

Pro 11 druhů a dva přírodní hybridy byl stanoveň stupeň ploidie. Vzorky pocházejí ze 39 lokalit v Rumunsku. Za pomoci flow cytometrie s DAPI barvením bylo celkem analyzováno 48 živých rostlin (u 22 rostlin byl také dostupný 1 rok starý herbářový materiál) a dalších 65 jeden rok starých herbářových položek. Zjištěny byly následující ploidní úrovně: F. callieri (4x), F. ovina (2x), F. pallens (2x), F. polesica (2x), F. pseudodalmatica (2x, 4x, 5x), F. pseudovaginata (2x), F. pseudovina (2x), F. pseudovina x F. rupicola (4x), F. rupicola (6x), F. vaginata (2x), F. vaginata x F. valesiaca (2x), F. valesiaca (2x) and F. xanthina (2x). Festuca pseudovaginata je dokumentována pro rumunskou flóru poprvé. Ve srovnání se živými vzorky měření z herbářových položek vykazovalo významě menší poměr ke standardu (P<0.001) a horší koeficienty variance píků (P<0.001). Několik druhů vykazovalo výraznou vnitrodruhovou variabilitu v obsahu DNA, která byla dokumentována při současném měření vzorků jako bimodální píky nebo dvojpíky. Maximální rozdíl byl 9.2% v relativním obsahu F. pallens, 5.5% u F. polesica, 4.2% u F. vaginata a 3.8% u F. rupicola. Diploidní F. xanhina (Festuca sect. Eskia Willk.) měla monoploidní obsah DNA 1.39–1.58-krát větší ve srovnání s druhy sekce Festuca.

Links

GA206/03/0228, research and development project
Name: Fylogeografie polyploidních komplexů v Evropě
Investor: Czech Science Foundation, Phylogeography of polyploid complexes in Europe
LC06073, research and development project
Name: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center
MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time