Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.

ČEJKOVÁ, Darina, Petra MATĚJKOVÁ and David ŠMAJS. Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54. (Promoters of Treponema pallidum: promoters for sigma-54.). In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2006, p. 5. ISBN 80-210-3942-6.

Basic information

• Original name: Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.
• Name in Czech: Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.
• Name (in English): Promoters of Treponema pallidum: promoters for sigma-54.
• Authors: ČEJKOVÁ, Darina, Petra MATĚJKOVÁ and David ŠMAJS.
• Edition: Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. p. 5-5, 2006.
• Publisher: Masarykova univerzita v Brně

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Medicine
• ISBN: 80-210-3942-6
• Keywords in English: T. pallidum ssp. pallidum; promoter; sigma-54
• Tags: promoter, sigma-54, T. pallidum ssp. pallidum

Abstract

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum, mikroaerofilní obligátní lidský patogen, způsobuje pohlavně přenosné onemocnění syfilis, které napadá různé tkáně a orgány. Různá stádia syfilis a schopnost infikovat různé orgány pravděpodobně vyžaduje regulaci genové exprese. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho pozitivního regulátoru FhlA. Funkcí sigma faktoru je vazba RNA–polymerázy k promotoru a zabránění nespecifické iniciace transkripce. Pro studium sigma-54 závislých promotorů byla použita analýza in silico, mapování promotorů pomocí PCR z cDNA (cDNA PCR) a transkripční fúze mezi predikovaným sigma-54 závislým promotorem a luxCDABE geny plazmidu pCS26, které slouží jako reportérový systém pro analýzu míry exprese. S využitím programu PromScan byly identifikovány sigma-54 závislé promotory v genomu T. p. pallidum Nichols.

Abstract (in English)

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScan software. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. Six possible sigma-54-dependent promoters were identified in the genome of T. pallidum.

Links

• GA310/04/0021, research and development project: Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR