Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

ČEJKOVÁ, Darina and David ŠMAJS. Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum. (Identification and characterization of sigma-54-dependent promoters of Treponema pallidum.). In Tomáškovy dny 2006. Sborník abstraktů. 2006.

Basic information

• Original name: Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.
• Name (in English): Identification and characterization of sigma-54-dependent promoters of Treponema pallidum.
• Authors: ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Tomáškovy dny 2006. Sborník abstraktů. 2006.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/06:00016081
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: sigma-54-dependent promoters; Treponema pallidum.
• Tags: sigma-54-dependent promoters, Treponema pallidum.

Abstract

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum je původcem syfilis, pohlavního onemocnění charakterizovaného více stádii a postižením různých orgánů. Je tedy pravděpodobné, že T. pallidum mění expresi svých genů během infekce lidského hostitele. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho promotorů. Funkcí sigma faktorů je vazba RNA–polymerázy k promotoru a specifická iniciace transkripce. Pro studium promotorů závislých na faktoru sigma-54 byla použita analýza in silico pomocí programu PromScan a transkripční fúze mezi promotory a geny luxCDABE plazmidu pCS26. Za přítomnosti dalšího plazmidu nesoucího treponemální gen pro sigma-54 (rpoN) můžeme pomocí tohoto systému analyzovat funkci jednotlivých predikovaných promotorů. Výsledky potvrzují přítomnost sigma-54 závislých promotorů v genomu T. pallidum Nichols. Treponemální faktor sigma-54 je částečně zaměnitelný s escherichiálním faktorem sigma-54, a proto je vhodné experimenty provádět v kmenech rpoN-.

Abstract (in English)

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScan software. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. The promoters of polA and tpF1 genes were shown to be dependent on overexpression of treponemal rpoN and fhlA both in wild type E. coli and, more extensively, in E. coli rpoN- or E. coli fhlA-. Regulation of polA and tpF1 genes was confirmed using Q-PCR technique.

Links

• GA310/04/0021, research and development project: Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR