Diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologických vzorcích pomocí PCR.

FLASAROVÁ, Magdalena and David ŠMAJS. Diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologických vzorcích pomocí PCR. (Diagnostics of Treponema pallidum in clinical material). In Jubilejní 50. studentská vědecká konference. Program a abstrakta. 2006.

Basic information

• Original name: Diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologických vzorcích pomocí PCR.
• Name in Czech: Diagnostika spirochety Treponema. pallidum v biologických vzorcích pomocí PCR
• Name (in English): Diagnostics of Treponema pallidum in clinical material
• Authors: FLASAROVÁ, Magdalena (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Jubilejní 50. studentská vědecká konference. Program a abstrakta. 2006.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/06:00016086
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: Treponema pallidum; clinical material
• Tags: clinical material, Treponema pallidum

Abstract

Cíl: Izolovat a detegovat treponemální DNA (mikroorganismu Treponema pallidum subsp. pallidum) z různých klinických materiálů od pacientů jak s podezřením na syfilis, tak ve stádiu primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním včetně kongenitální syfilis. U získaných izolátů jednotlivých kmenů pak provést kmenovou typizaci a identifikaci. Z 30-ti vyšetřovaných stěrů jsme nalezli 6 pozitivních stěrů od 3 pacientů ve stádiu primární a sekundární syfilis a 1 pozitivní stěr od jednoho novorozence. Výsledky sekvenací ve dvou případech ukázaly výskyt kmene sekvenčně totožného s kmenem SS14 a v dalších dvou případech jsme nalezli sekvenční změny v lokusech TP0548 a TP0136, které prokázaly výskyt unikátních syfilitických kmenů, doposud nepopsaných u Treponema pallidum subsp. pallidum.

Abstract (in English)

In this study, we used molecular diagnostics of the spirochete Treponema pallidum in biological materials. The tested samples were collected from patients with suspect syphilis, and patients diagnosed with primary, secondary, early or late latent stages of syphilis. Samples of one patient with congenital syphilis were also analyzed. Seven swabs samples were PCR positive (from 4 patients with primary or secondary syphilis) and all samples from the patient with congenital syphilis. For strain identifications, the TP0548, TP0136, and TP0319 genes were amplified and obtained PCR products were sequenced. In two cases, sequences identical to the strain SS14 and in another two cases, unique sequences in locuses TP0548 and TP0136 were found.

Links

• GA310/04/0021, research and development project: Name: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Czech Science Foundation, Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR