J 2006

Evaluation of CD34+ - and Lin- -selected cells from peripheral blood stem cell grafts of patients with lymphoma during differentiation in culture ex vivo using a cDNA microarray technique

KOUTNÁ, Irena, Martin KLABUSAY, Viera HRABČÁKOVÁ, Petr KRONTORÁD, Zbyněk SVOBODA et. al.

Basic information

Original name

Evaluation of CD34+ - and Lin- -selected cells from peripheral blood stem cell grafts of patients with lymphoma during differentiation in culture ex vivo using a cDNA microarray technique

Name in Czech

Analýza CD34+ a Lin- kmenových buněk z periferních krve pacientů s lymfomem během ex vivo diferenciace v kultuře pomocí techniky DNA microarray

Authors

KOUTNÁ, Irena (203 Czech Republic, guarantor), Martin KLABUSAY (203 Czech Republic), Viera HRABČÁKOVÁ (703 Slovakia), Petr KRONTORÁD (203 Czech Republic), Zbyněk SVOBODA (203 Czech Republic), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic) and Jiří MAYER (203 Czech Republic)

Edition

Experimental hematology, Netherlands, Elsevier Science Inc, 2006, 0301-472X

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

Netherlands

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 3.408

RIV identification code

RIV/00216224:14330/06:00016104

Organization unit

Faculty of Informatics

UT WoS

000238747100003

Keywords in English

Hematopoietic stem cells; hematopoietic transplantation; cytokines; ex vivo expansion; immunomagnetic separation

Tags

cbia-web, cytokines, ex vivo expansion, Hematopoietic stem cells, hematopoietic transplantation, immunomagnetic separation

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 12/12/2006 10:39, doc. RNDr. Irena Koutná, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

Objective. Hematopoietic stem cells (enriched in fraction of CD34+ cells) have the ability to regenerate hematopoiesis in all of its lineages, and this potential is clinically used in transplanting bone marrow or peripheral blood stem cells. Our objective was to assemble a suitable method for evaluating gene expression in enriched populations of hematopoietic stem cells. We compared biologic properties of cells cultured ex vivo obtained using two different ways of immunomagnetic separation (positive selection of CD34+ cells and negative selection of Lin2 cells) by means of a cDNA microarray technique. Methods. CD34+ and Lin2 cells were enriched from peripheral blood stem cell (PBSCs) grafts of patients with non-Hodgkins lymphoma. Isolated cells were in the presence of cytokine PBSCs, FLT-3 ligand, interleukin-3, interleukin-6, and granulocyte colony-stimulating factor. At days 0, 4, 6, 8, 10, 12, and 14 cells were harvested and analyzed by cDNA microarrays. Total cell expansion, CD34+, colony-forming unit for granulocyte-macrophage and megakaryocytes expansion, vitality, and phenotype of cells were also analyzed. Results. cDNA microarray analysis of cultured hematopoietic cells proved equivalence of the two enrichment methods for PBSC samples and helped us characterize differentiating cells cultured ex vivo. Conclusion. Our methodologic approach is helpful in characterizing cultured hematopoietic cells cultured ex vivo, but it is also suitable for more general purposes. Equivalence of CD34+ and Lin2 selection methods from PBSC samples proved by cDNA microarray may have an implication for graft manipulation in an experimental setting of hematopoietic transplantation. Total cell expansion and colony formation and phenotype from CD34+ selected and from Lin2 samples were comparable.

In Czech

Cíl. Hematopoetické kmenové buňky (frakce CD34+) mají schopnost diferencovat do všech typů krevních buněk a tato schopnost je využívána při transplantacích kostí dřeně a kmenových buněk z periferní krve. Naším cílem bylo vypracovat vhodnou metodu pro stanovení genové exprese v populacích hematopoetických kmenových buněk. Technikou cDNA microarrays jsme porovnávali biologické vlastnosti buněk kultivovaných ex vivo, které byly získány za použití dvou rozdílných metod imunomagnetické separace (pozitivní selekce CD34+ buněk a negativní selekce Lin-). Metody. CD34+ a Lin- buňky jsme izolovali z kmenových buněk z periferní krve (PBSCs) pacientů s non-Hodkingovým lymfomem. Buňky byly vystaveny působení cytokinu PBSCs, FLT-3 ligandu, interleukinu-3, interleukinu-6 a granulocytárnímu faktoru stimulujícímu kolonie. Odběry a analýza buněk na cDNA microarrays proběhly ve dnech 0, 4, 6, 8, 10, 12 a 14. Byla též analyzována totální buněčná expanze, CD34+, colony-forming unit pro granulocyt-makrofágovou a megakaryocytovou expanzi, vitalita a fenotyp buněk. Výsledky. cDNA microarray analýza hematopoetických buněk prokázala rovnocennost obou metod u PBSC vzorků a pomohla charakterizovat diferenciaci buněk pěstovaných ex vivo. Závěr. Náš postup je vhodný pro charakterizaci hematopoetických kmenových buněk pěstovaných ex vivo, ale také k obecnějším účelům. Rovnocennost CD34+ a Lin- selekčních metod u PBSC vzorků, potvrzená cDNA microarrays, by mohla nalézt uplatnění při manipulacích se štěpy při hematopoetických transplantacích. Totální buněčná expanze, utváření kolonií a fenotyp byl u CD34+ a Lin- vzorků srovnatelný.

Links

GP301/04/P136, research and development project
Name: Včasná diagnostika leukémií užitím technologie DNA-mikročipů a sledováním epigenetických změn
Investor: Czech Science Foundation, Early diagnostics of leukemia using DNA-microchip technology and by monitoring of epigenetic changes
1A8241, research and development project
Name: Nové možnosti diagnostiky leukémií s využitím technologie DNA-mikročipů
Investor: Ministry of Health of the CR, New possibilities of diagnostics of leukemia using DNA-microarrays
Displayed: 4/11/2024 08:54