V originále
To understand how genes are distributed on chromosomes we bring new insights into gene positional clustering and its properties. We have made a large-scale analysis of three types of differentiation and we observed that genes that subsequently enter into different cell processes are positionally clustered on chromosomes. Genes from the clusters are transcribed subsequently with respect to time kinetics and also to position. This means that the genes related to a cellular process are clustered together, independent of the period of time during which they are active and important for the process. Our results also demonstrate not only that there are general regions of increased or decreased levels of gene expression, but also that, in fact, in some chromosome regions we can find clustering of genes related to specific cell processes. The results provided in this paper also support the theory of transcription factories and show that transcription of genes from the clusters is managed by softer epigenetic mechanisms.
Česky
Naše práce přináší nové poznatky o vlastnostech genů a jejich pozičním klastrování, a přispívá k pochopení distribuce genů na chromozomech. Provedli jsme globální analýzu tří typů diferenciace a pozorovali jsme poziční klastrování genů na chromozomech, které postupně vstupují do rozdílných buněčných procesů. Geny z klastrů jsou transkribovány postupně, vzhledem k časové kinetice a také jejich pozici. Z toho vyplývá, že geny podílející se na určitém procesu v buňce jsou umístněny v klastrech, nezávisle na čase jejich aktivace v daném procesu. Naše výsledky dokazují nejen existenci regionů se zvýšenou či sníženou hladinou exprese, ale také to, že v určitých chromozomálních regionech se nachází klastry genů, podílejících se na specifickém buněčném procesu. Naše výsledky mimo jiné podporují teorii "transkripčních továren" a ukazují, že při transkripci z klastrů hrají důležitou roli jemnější epigenetické mechanismy