Výhody funkční metody FASAY při analýze nádorového supresoru p53 u vybraných případů difúzního velkobuněčného B lymfomu

ŠMARDOVÁ, Jana, František ZEDEK, Barbora RAVČUKOVÁ, Diana GROCHOVÁ, Jana VAŇKOVÁ, Iva KROUPOVÁ and Pavel FABIAN. Výhody funkční metody FASAY při analýze nádorového supresoru p53 u vybraných případů difúzního velkobuněčného B lymfomu (Advantage of FASAY in analysis of the p53 tumor suppressor in selected cases of diffuse large B cell lymphoma). In ABSTRAKTA. Olomouc: Univerzita Palackeho Olomouc, 2006, p. 20-21. ISBN 80-239-8240-0.

Basic information

• Original name: Výhody funkční metody FASAY při analýze nádorového supresoru p53 u vybraných případů difúzního velkobuněčného B lymfomu
• Name in Czech: Výhody funkční metody FASAY při analýze nádorového supresoru p53 u vybraných případů difúzního velkobuněčného B lymfomu
• Name (in English): Advantage of FASAY in analysis of the p53 tumor suppressor in selected cases of diffuse large B cell lymphoma
• Authors: ŠMARDOVÁ, Jana (203 Czech Republic, guarantor), František ZEDEK (203 Czech Republic), Barbora RAVČUKOVÁ (203 Czech Republic), Diana GROCHOVÁ (203 Czech Republic), Jana VAŇKOVÁ (203 Czech Republic), Iva KROUPOVÁ (203 Czech Republic) and Pavel FABIAN (203 Czech Republic).
• Edition: Olomouc, ABSTRAKTA, p. 20-21, 2 pp. 2006.
• Publisher: Univerzita Palackeho Olomouc

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/06:00017841
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 80-239-8240-0
• Keywords in English: p53; FASAY; B cell lymphoma
• Tags: B cell lymphoma, FASAY, p53

Abstract

Provedli jsme analýzu aberací p53 u 40 případů DLBCL imunohistochemií, westernovým přenosem, sekvenováním DNA, FISH a funkční analýzou separovaných alel v kvasinkách (FASAY). Na vybraných případech demonstrujeme výhody komplexního vyšetření p53 a několik předností FASAY: vysokou citlivost, schopnost zachytit mutace, které jsou imunohistochemicky nedetekovatelné, schopnost rozlišit mutace narušující pouze částečně funkci p53 a možnost přípravy templátů pro sekvenování DNA tam, kde není možná analýza gDNA ani cDNA připravené přímo z nádorové tkáně pro nízké zastoupení mutantní varianty genu p53.

Abstract (in English)

We performed analysis of aberrations of the p53 gene in 40 cases of DLBCL by immunohistochemistry, western blotting, DNA sequencing, FISH and functional analysis of separated alleles in yeast (FASAY). In selected cases, we demonstrate advantages of complex analyses of p53 and beneficial features of FASAY, such as high sensitivity, ability to identify the mutations that are undetectable by immunohistochemistry. ability to identify partially inactivating p53 mutations, and ability to provide templates for DNA sequencing in those cases when analyses of gDNA and cDNA are not possible from tumor tissue due to low incidence of mutant variant of the p53 gene.

Links

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations