ŠPANOVÁ, Alena, Bohuslav RITTICH, Igor ŠTYRIAK, Iveta ŠTYRIAKOVÁ and Daniel HORÁK. Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres. Journal of Chromatography A. Amsterdam: Elsevier, 2006, vol. 1130, No 1, p. 115-121. ISSN 0021-9673.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres
Name in Czech Izolace DNA v kvalitě vhodné pro PCR ze sedimentů Bajkalského jezera pomocí magnetických pomerních částic funkcionalizovaných karboxylovými skupinami
Authors ŠPANOVÁ, Alena (203 Czech Republic, guarantor), Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic), Igor ŠTYRIAK (703 Slovakia), Iveta ŠTYRIAKOVÁ (703 Slovakia) and Daniel HORÁK (203 Czech Republic).
Edition Journal of Chromatography A, Amsterdam, Elsevier, 2006, 0021-9673.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Netherlands
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 3.554
RIV identification code RIV/00216224:14310/06:00016161
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000241092300014
Keywords in English Magnetic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); Lake Baikal sediments; Microbial DNA Magnetic separation; Polymerase chain reaction (PCR)
Tags Lake Baikal sediments, Magnetic microspheres, Microbial DNA Magnetic separation, P(HEMA-co-EDMA), Polymerase chain reaction (PCR)
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc., učo 1639. Changed: 19/12/2006 16:50.
Abstract
Carboxyl group-containing magnetic nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-ethylene dimethacrylate) (P(HEMA-co-EDMA)) microspheres were used for the isolation of polymerase chain reaction(PCR)-ready DNA from samples of Baikal sediments. The occurence of false -negative results in PCR caused by the presence of extracelular inhibitors in DNA samples was solved using solid phase reversible DNA immobilisation. PCR-ready DNA was reversibly adsorbed to the microspheres in the presence of 8.0% PEG 6000 and 2.0 M sodium chloride concentrations. The adsorbed DNA was released from the microspheres in a low ioninic strength TE buffer. The quality of isolated DNA was checked by PCR amplification.
Abstract (in Czech)
Magnetické neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-ethylen dimethakrylát) (P(HEMA-co-EDMA)) mikročástice byly použity k izolaci DNA z bajkalských sedimentů v kvalitě vhodné pro PCR. Výskyt falešně negativních výsledků v PCR byl způsoben přítomností extracelulárních inhibitorů ve vzorcích DNA. K jejich odstranění byla použita metoda reversibilní imobilizace DNA. DNA byla reversibilně adsorbována na mikročástice v přítomnosti 8,0% PEG 6000 a 2,0 m NaCl. Adsorbovaná DNA byla eluována TE pufrem o nízké iontové síle. Kvalita izolované DNA byla ověřována pomocí PCR.
Links
GA203/05/2256, research and development projectName: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Czech Science Foundation, Magnetic stimuli-responsive hydrophilic polymer microspheres for biomedicine/bioengineering
PrintDisplayed: 4/8/2024 07:13