D 2006

Influence of magnetic particles on the reproducibility of RAPD and rep-PCR fingerprinting of lactic acid bacteria

RITTICH, Bohuslav, Jana KŘÍŽOVÁ, Alena ŠPANOVÁ, Petra NĚMCOVÁ, Daniel HORÁK et. al.

Basic information

Original name

Influence of magnetic particles on the reproducibility of RAPD and rep-PCR fingerprinting of lactic acid bacteria

Name in Czech

Vliv magnetických částic na reprodukovatelnost RAPD a rep-PCR fingrprintů

Authors

RITTICH, Bohuslav (203 Czech Republic, guarantor), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Czech Republic), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic), Petra NĚMCOVÁ (203 Czech Republic) and Daniel HORÁK (203 Czech Republic)

Edition

York, Velká Británie, Ninth International Symposium on hyphenated techniques in chromatography and hyphenated chromatographic analyzers, HTC-9, p. P167, 1 pp. 2006

Publisher

Royal Society of Chemistry

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00024563

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

Magnetic particles; HEMA-co-GMA; Bifidobacterium; RAPD; rep-PCR; reproducibility

Tags

Změněno: 22/1/2009 18:56, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Abstract

ORIG CZ

V originále

DNA was isolated from Bifidobacterium cells using phenol extraction metod, salting out using 6 M NaCl, and adsorption on magnetic poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-glycidyl methacrylate) (HEMA-co-GMA) particles containing carboxyl groups. It was shown that DNA eluted from magnetic particles into TE buffer can be succesfully used in molecular fingerprinting procedures. The reproducibility of tested methods were comparable with phenol extraction method.

In Czech

DNA byla izolována z buněk bifidobakterií pomocí fenolové extrakce, vysolováním 6 M NaCl a adsorpcí na magnetické poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-glycidyl methakrylát) (HEMA-co-GMA) částice pokryté karboxylovými skupinami. Bylo zjištěno, že DNA eluovaná z magnetických částic za použití TE pufru může být použita při tvorbě fingrprintů. Reprodukovatelnost testovaných metod byla srovnatelná s fenolovou extrakcí.

Links

GA203/05/2256, research and development project
Name: Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
Investor: Czech Science Foundation, Magnetic stimuli-responsive hydrophilic polymer microspheres for biomedicine/bioengineering
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
1G46045, research and development project
Name: Molekulárně biologická analýza tuzemského fondu produkčních kmenů baktérií mléčného kvašení.
Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Introduction of new traits for quality and stability improving in variety production of selcted leguminous species by hybridization methods