Detailed Information on Publication Record
2007
Screening of genomic imbalances in glioblastoma multiforme using high-resolution comparative genomic hybridization
VRANOVÁ, Vladimíra, Eva NEČESALOVÁ, Petr KUGLÍK, Pavel CEJPEK, Martina PEŠÁKOVÁ et. al.Basic information
Original name
Screening of genomic imbalances in glioblastoma multiforme using high-resolution comparative genomic hybridization
Name in Czech
Screening genetických abnormalit u glioblastomu s využitím komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením
Authors
VRANOVÁ, Vladimíra (703 Slovakia), Eva NEČESALOVÁ (203 Czech Republic), Petr KUGLÍK (203 Czech Republic), Pavel CEJPEK (203 Czech Republic), Martina PEŠÁKOVÁ (203 Czech Republic), Eva BUDINSKÁ (703 Slovakia), Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic) and Renata VESELSKÁ (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Oncology Reports, 2007, 1021-335X
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impact factor
Impact factor: 1.597
RIV identification code
RIV/00216224:14310/07:00021808
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000243611400028
Keywords in English
CGH; HR-CGH; glioblastoma multiforme; molecular cytogenetics
Tags
International impact, Reviewed
Změněno: 18/6/2009 12:54, prof. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.
V originále
Comparative genomic hybridization (CGH) is a molecular cytogenetic technique that allows genome-wide analysis of DNA sequence copy number differences. We have applied conventional CGH and recently developed high resolution CGH (HR-CGH) to tumour samples from 18 patients with glioblastoma multiforme (GBM) to compare the sensitivity of CGH and HR-CGH in the screening of chromosomal abnormalities. The abnormalities were studied in topologically different central and peripheral tumour parts. A total of 78 different changes were observed using CGH (0-16 per tumour, median 3.5) and 154 different changes using HR-CGH (0-21 per tumour, median 6). Using HR-CGH, losses were more frequent than gains. The representation of the most prominent changes revealed by both methods was similar and was comprised of the amplification of 7q12-13 and 12q12-q15, the gain of 7, 3q and 19 and the loss of 10, 9p, and 13q. However, HR-CGH detected a few other abnormalities (loss of 6, 14q, 15q, and 18q and gain of 19), which were rarely revealed by CGH. Using HR-CGH, the numbers and types of chromosomal changes detected in the central and peripheral parts of GBM were almost the same. The loss of chromosomes 10 and 9p and the gain of chromosomes 7 and 19 were the most frequent chromosomal alterations in both tumour parts. Our results from GBM analysis showed that HR-CGH technology may reveal new, recurrent genetic alterations involving genes known to participate in tumorigenesis and in the progression of several human malignancies and therefore may allow for a more accurate genetic characterization of these tumours.
In Czech
S využitím konvenční komparativní genomové hybridizace (CGH) a novější komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) jsme provedli analýzu vzorků nádorové tkáně celkem 18 pacientů s diagnózou glioblastoma multiforme s cílem porovnat citlivost obou uvedených metod při vyhledávání chromosomálních abnormalit. S využitím konvenční CGH bylo zaznamenáno celkem 78 různých změn (0-16 na nádor, medián 3,5), zatímco s využitím HR-CGH bylo detekováno celkem 154 různých změn (0-21 na nádor, medián 6), přičemž ztráty genetického materiálu byly s využitím HR-CGH zaznamenány častěji, než zisky. Nejčastější změny, které bylo možné detekovat oběma metodami, byly amplifikace oblastí 7q12-13 a 12q12-q15, zisky oblastí 7, 3q a 19 a ztráty oblastí 10, 9p a 13q. Pomocí metody HR-CGH byly kromě toho prokázány další genetické změny (ztráty oblastí 6, 14q, 15q a 18q a zisk 19), které nebylo možné zjistit metodou konvenční CGH.
Links
| MSM0021622415, plan (intention) |
| ||
| OC B19.001, research and development project |
|