D 2006

Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

ŠPANOVÁ, Alena, Jana KŘÍŽOVÁ, Radka BURDYCHOVÁ, Vladimír DRÁB, Bohuslav RITTICH et. al.

Basic information

Original name

Taxonomic analysis and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

Name in Czech

taxonomická analýza a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761

Authors

ŠPANOVÁ, Alena (203 Czech Republic, guarantor), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Czech Republic), Radka BURDYCHOVÁ (203 Czech Republic), Vladimír DRÁB (203 Czech Republic) and Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic)

Edition

Praha, 10th International symposium on the genetics of industrial microorganisms, p. P046, 1 pp. 2006

Publisher

Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00031777

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-239-7323-1

Keywords in English

Bifidobacterium; ARDRA; RAPD; rep-PCR; sequencing; species identification

Tags

Tags

International impact
Změněno: 2/1/2007 14:50, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Abstract

ORIG CZ

V originále

DNA fingerprinting methods (ARDRA, RAPD, rep-PCR) have been applied for discrimination of Bifidobacterium species. Sixteen Bifidobacterium strains of eleven species which were used to evaluate the discrimination power of the above-mentioned methods were obtained from the Czech Collection of Microorganisms (CCM, Brno, Czech Republic), the American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, USA), and the Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ, Braunschweig, Germany). In characterisation of the studied strains it was found that the results obtained for the strain B. adolescentis CCM 3761 did not correspond with its taxonomic position and the strain should be reclassified as B. pseudocatenulatum. The amplicons of the 16S rDNA region of B. adolescentis CCM 3761 and B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T, and B. adolescentis CCM 4987T were used for sequencing of DNA and for confirmation of species identification.

In Czech

Typizační metody (ARDRA, RAPD, rep-PCR) byly použity pro rozlišení bifidobakterií. K ověření rozlišovací schopnosti výše uvedených metod byly použity sbírkové kmeny (CCM, ATCC, DSZM). Bylo zjištěno, že kmen Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Amplikony z úseku 16S rDNA kmenů B. adolescentis CCM 3761,B. catenulatum CCM 7094, B. pseudocatenulatum DSM 16992T a B. adolescentis CCM 4987T byly použity k sekvencování DNA a potvrzení druhové identifikace.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
QF3169, research and development project
Name: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin
Investor: Ministry of Agriculture of the CR, The use of procedures on basis of molecular genetics in acquiring of new bacterial strains with probiotic properties with the aim to increase specific genetic sources for production of functional foods