Detailed Information on Publication Record
2006
Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods
RITTICH, Bohuslav, Jana KŘÍŽOVÁ and Alena ŠPANOVÁBasic information
Original name
Comparative study on the identification of Bifidobacterium strains using DNA fingerprinting methods
Name in Czech
Srovnávací studie identifikace bifidobakterií s využitím DNA typizačních metod
Authors
RITTICH, Bohuslav (203 Czech Republic, guarantor), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Czech Republic) and Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
Praha, 5th Meeting of the European Mucosal Immunology Group, p. 126-126, 1 pp. 2006
Publisher
Czech Immunological Society
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/06:00018075
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
Bifidobacterium; identification; ARDRA; rep-PCR
Tags
Tags
International impact
Změněno: 2/1/2007 16:04, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
V originále
Methods based on genus-specific PCR, species-specific PCR, amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) of PCR amplicons (914 bp) using 6 restriction enzymes, DNA fingerprinting methods - RAPD with 7 random primers and rep-PCR using both BOXA1R and (GTG)5 ones, were used to differentiate among 16 type and collection Bifidobacterium strains of 11 species of human origin, B. animalis and B. lactis and Bifidobacterium spp. collected in Culture Collection of Dairy Microorganisms (CCDM, Tábor, Czech Republic). The highest discrimination power had the RAPD method which distinguished all tested species. Bifidobacterium sp. CCDM 223 strain was identified as Bifidobacterium adolescentis species. The other six Bifidobacterium sp. CCDM were classified as species.
In Czech
Metody založené na rodově a druhově specifické PCR, restrikční analýze (ARDRA) PCR amplikonu (914 bp) s použitím 6 restrikčních endonukleáz, RAPD s použitím 7 náhodných primerů, rep-PCR s použitím BOXA1R a (GTG)5 primerů byly použity k k rozlišení 16 typových a sbírkových kmenů bifidobakterií náležejících do 11 druhů lidského původu, B. animalis a B. lactis. Nejvyšší rozlišovací schopnost měla metoda RAPD, pomocí které byly rozlišeny všechny analyzované kmeny. Dále byly analyzovány kmeny ze sbírky Laktoflora (CCDM, Tábor, Czech Republic).Kmen Bifidobacterium sp. CCDM 223 byl identifikován jako Bifidobacterium adolescentis.Dalších šest kmenů bylo určeno jako Bifidobacterium lactis.
Links
| MSM0021622415, plan (intention) |
| ||
| 1G58097, research and development project |
|