V originále
The aim of this work was to optimize the conditions for DNA and RNA adsorption and desorption depending on the composition of the binding buffer. For this study, chicken erythrocyte DNA and calf liver RNA were used as model compounds. The final binding buffer composition was optimized using the following combinations: 4, 6, 8, and 12% PEG, and 1.0, 1.5, 2.0, and 2.5M NaCl. The binding buffer containing 8% PEG and 2M NaCl (final concentration) was shown to be the most appropriate combination for further studies. Separated DNA was eluted using TE buffer. The method developed was applied for isolation of PCR-ready DNA from mycobacterial cells using magnetic particles. Mycobacterial DNA from the eluate was detected by amplification of the IS900 and IS901 elements, special markers for the species Mycobacterium sp. avium and Mycobacterium sp. paratuberculosis. .
In Czech
Cílem této práce bylo optimalizovat pro adsorpci a desorpci v závislosti na složení vazebného pufru.DNA z kuřecích erytrocytů a RNA z hovězích jater byly použity jako modelové sloučeniny. Optimalizace vazebného pufru byla provedena z následujících kombinací: 4, 6, 8, a 12% PEG; a 1,0, 1,5, 2,0, and 2,5 M NaCl. Vazebný pufr obsahující 8 % PEG a 2 M NaCl byl shledán jako nejvhodnější kombinace pro další studue. Separovaná DNAbyla eluována pomocí TE pufru. Vyvinutý postup byl využit pro izolaci DNA v kvalitě pro PCR z buněk mykobakterií za použitímagnetických částic. DNA v eluátu byla detekována amplifikací IS900 a IS901 elementů, speciciálních markerů pro druhy Mycobacterium sp. avium a Mycobacterium sp. paratuberculosis.