Detailed Information on Publication Record
2006
In situ hybridization for mRNA detection in Arabidopsis tissue sections.
HEJÁTKO, Jan, P. BREWER, M. HEISLER, Jiří FRIML, Eva BENKOVÁ et. al.Basic information
Original name
In situ hybridization for mRNA detection in Arabidopsis tissue sections.
Name in Czech
In situ hybridizace pro detekci mRNA na pletivových řezech Arabidopsis.
Authors
HEJÁTKO, Jan (203 Czech Republic, guarantor), P. BREWER (36 Australia), M. HEISLER (276 Germany), Jiří FRIML (203 Czech Republic) and Eva BENKOVÁ (703 Slovakia)
Edition
Nature Protocols, U.S.A. Nature Publishing Group, 2006, 1745-2473
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
United States of America
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impact factor
Impact factor: 12.040
RIV identification code
RIV/00216224:14310/06:00018084
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000251155400049
Keywords in English
in situ mRNA localization; tissue sections; plants
Tags
International impact, Reviewed
Změněno: 9/4/2010 16:04, doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
V originále
Plant biology is currently confronted with an overflow of expression profile data provided by high-throughput microarray transcription analyses. However, the tissue and cellular resolution of these techniques is limited. Thus, it is still necessary to examine the expression pattern of selected candidate genes at a cellular level. Here we present an in situ mRNA hybridization method that is routinely used in the analysis of gene expression patterns. The protocol is optimized for mRNA localizations in sectioned tissue of Arabidopsis seedlings including embryos, roots, hypocotyls, young primary leaves and flowers. The detailed protocol, recommended controls and troubleshooting are presented along with examples of application. The total time for the process is 10 days.
In Czech
In situ lokalizace genů je technika, která umožňuje přesnou lokalizaci transkripční aktivity jednotlivých genů na úrovni pletiv i jednotlivých buněk. Zde prezentujeme metodu, kteréá je rutinně využívána v analýze genové exprese a to na řezech z mnoha různých typů pletiv Arabidopsis thaliana, včetně embryí, kořenů, hypokotylů, mladých listů a květů. Je předkládán detailní popis celé metody včetně doporučených kontrol a řešení potenciálních problémů s příklady aplikace protokolu na konkrétní geny. Celkový čas nutný k provedení metody je 10 dní.
Links
| LC06034, research and development project |
| ||
| MSM0021622415, plan (intention) |
|