Detailed Information on Publication Record
2005
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
ŠMARDOVÁ, Jana, Miluše SVITÁKOVÁ, Barbora RAVČUKOVÁ, Diana GROCHOVÁ, Jana VAŇKOVÁ et. al.Basic information
Original name
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
Name in Czech
Funkční analýza separovaných alel v kvasinkách: spolehlivá metoda k určení statutu nádorového supresoru p53
Name (in English)
Functional analysis of separated alleles in yeast: a reliable method for assesment of the p53 status
Authors
ŠMARDOVÁ, Jana (203 Czech Republic, guarantor), Miluše SVITÁKOVÁ (203 Czech Republic), Barbora RAVČUKOVÁ (203 Czech Republic), Diana GROCHOVÁ (203 Czech Republic), Jana VAŇKOVÁ (203 Czech Republic) and Iva KROUPOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
Olomouc, Dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, p. 18-18, 1 pp. 2005
Publisher
MEDUCA
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/05:00021853
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
FASAY; p53; p53 transactivation; gap repair
Tags
Tags
International impact
Změněno: 15/1/2007 08:59, prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
V originále
FASAY je semikvantitativní metoda pro detekci mutací p53 v klinickém materiálu, obvykle v nádorových tkáních a periferní krvi. Protein p53 je odvozen z mRNA izolované z testovaného materiálu pomocí RT-PCR a jeho transaktivační schopnost je vyhodnocena v kvasinkových buňkách prostřednictvím ADE2 reportéru. Transaktivace proteinem p53 je stanovena podle barvy kvasninkových kolonií na agarových plotnách s nízkým obsahem adeninu. Kvasinkové buňky tvoří velké bílé kolonie pokud byl reportérský gen aktivován funkčním proteinem p53 nebo malé červené kolonie, pokud reportér nebyl aktivován. FASAY ná tyto výhody: (1) analyzuje obě alely p53 odděleně, (2) její vysoká citlivost umožňuje detekci mutací p53 i pokud v případě, že mutovaných buněk je v buněné populaci pouhých 10%, (3) umožňuje rozlišení plně a částečně inaktivujících mutací, (4) analyzuje podstatnou část genu p53, (5) umožňuje snadnou přípravu templátů pro sekvenování p53.
In English
FASAY is a sensitive semi-quantitative method of detection of p53 mutations in clinical material, such as tumor tissues, peripheral blood cells, etc. The p53 is derived from mRNA of analyzed material by RT-PCR and its transactivation ability is tested in yeast cells by using of ADE2 reporter gene. Transactivation by p53 is assessed simply according to the color of yeast colonies growing on agar plates with lovele of adenine. Yeast cells form either large white colonies if the reporter was activated by functional p53 or small red colonies if the reporter was not activated. FASAY possesses several advantages: (1) it analyzes both alleles of the p53 gene separately, (2) its high sensitivity allows detection of about 10% of p53 mutation harboring cells among mostely negative cells, (3) it can distinguish fully inactivating p53 mutations from partially inactivating ones, (4) it analyzes substantial part of the p53 gene, (5) it allows preparation of template useful for sequencing of the p53 gene.
Links
| MSM0021622415, plan (intention) |
|