VYUŽITÍ DNA MARKERŮ PŘI IDENTIFIKACI NOVÝCH GENŮ ODOLNOSTI K PADLÍ TRAVNÍMU (BLUMERIA GRAMINIS F. SP. HORDEI) U JEČMENE

TETUROVÁ, Kateřina, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL a Antonín DREISEITL. VYUŽITÍ DNA MARKERŮ PŘI IDENTIFIKACI NOVÝCH GENŮ ODOLNOSTI K PADLÍ TRAVNÍMU (BLUMERIA GRAMINIS F. SP. HORDEI) U JEČMENE. In XI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů - Sborník příspěvků. 1. vydání. Brno: Masarykova univerzita, 2007, s. 87-88. ISBN 978-80-210-4234-6.

Základní údaje

• Originální název: VYUŽITÍ DNA MARKERŮ PŘI IDENTIFIKACI NOVÝCH GENŮ ODOLNOSTI K PADLÍ TRAVNÍMU (BLUMERIA GRAMINIS F. SP. HORDEI) U JEČMENE
• Název anglicky: Identification of new resistance genes to powdery mildew (Blumeria graminis f. sp. hordei) in barley using DNA markers
• Autoři: TETUROVÁ, Kateřina (203 Česká republika), Jana ŘEPKOVÁ (203 Česká republika, garant), Pavel LÍZAL (203 Česká republika) a Antonín DREISEITL (203 Česká republika).
• Vydání: 1. vydání. Brno, XI. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů - Sborník příspěvků, od s. 87-88, 2 s. 2007.
• Nakladatel: Masarykova univerzita

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/07:00020249
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 978-80-210-4234-6
• Klíčová slova anglicky: barley; powdery mildew; resistance genes; DNA markers
• Štítky: barley, DNA markers, powdery mildew, resistance genes

Anotace

15 zdrojů odolnosti (H. v. ssp. spontaneum) k padlí travnímu bylo studováno s cílem lokalizovat nové geny rezistence do genetické mapy ječmene pomocí DNA markerů a vysytit odpovídající oblasti chromozomů co nejvíce markery. Analýzy byly prováděny s rostlinami populací F2. K mapování byly využity mikrosatelitové markery a pro oblasti genomu s nedostatkem polymorfních markerů bylo dále 11 markerů STS (sequence-tagged site) konvertováno na nové markery typu CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence); polymorfismus byl testován po štěpení produktů PCR vhodnými restrikčními enzymy. Statistická významnost vazby byla ověřena v programu MapManager QTX, který také určil pořadí a vzdálenosti mezi vázanými markery a pravděpodobné pozice genů rezistence. U křížení Tiffany x PI466197 bylo k mapování ze 117 markerů SSR použito 38 polymorfních markerů a ze 4 nově vytvořených CAPS markerů na chromozomu 2H byly použity 3 polymorfní markery. Po zpracování dat 113 rostlin generace F2 byl jeden gen lokalizován na chromozomu 1H mezi markery Bmac0213 a MGB402 (lokus Mla) a druhý, nově identifikovaný gen na chromozomu 2H mezi markery Bmac0134 a MWG878, 4 cM od Bmac0134.

Anotace anglicky

15 wild barley (H. v. ssp. spontaneum) sources of resistance to powdery mildew were studied in order to localize the resistance genes on barley genetic map using DNA markers and saturate the corresponding chromosome regions with more tightly linked markers. The analyses were performed in F2 populations. Microsatellite markers were used for mapping and for the regions with few polymorphic markers, 11 STS (sequence-tagged site) markers were converted into new CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence) markers; their polymorphism was tested after cleavage of the PCR products with suitable restriction enzymes. The data from F2 plants of all genotypes were analysed in the MapManager QTX program to assign the order and distances between the markers and the probable positions of the resistance genes. In Tiffany x the accession PI466197, 38 out of 117 SSR and 3 out of 4 newly developed CAPS markers on chromosome 2H were used. One resistance gene was located between the markers Bmac0213 and MGB402 on chromosome 1H (in the Mla locus) and the other, newly identified gene was located on chromosome 2H between Bmac0134 and MWG878, 4 cM from Bmac0134.

Návaznosti

• GA522/06/0608, projekt VaV: Název: Vývoj DNA markerů a konstrukce genetické mapy k lokalizaci nových genů odolnosti ječmene ozimého k padlí travnímu

Investor: Grantová agentura ČR, Vývoj DNA markerů a konstrukce genetické mapy k lokalizaci nových genů odolnosti ječmene ozimého k padlí travnímu

• GD204/05/H505, projekt VaV: Název: Vývojová genetika rostlin

Investor: Grantová agentura ČR, Vývojová genetika rostlin