J 2007

Incidence of the main genetic markers in glioblastoma multiforme is independent of tumor topology

NEČESALOVÁ, Eva, Vladimíra VRANOVÁ, Petr KUGLÍK, Pavel CEJPEK, Marie JAROŠOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Incidence of the main genetic markers in glioblastoma multiforme is independent of tumor topology

Name in Czech

Výskyt hlavních genetických markerů u multiformního glioblastomu je nezávislý na topologii nádoru

Authors

NEČESALOVÁ, Eva (703 Slovakia), Vladimíra VRANOVÁ (203 Czech Republic), Petr KUGLÍK (203 Czech Republic), Pavel CEJPEK (203 Czech Republic), Marie JAROŠOVÁ (203 Czech Republic), Martina PEŠÁKOVÁ (203 Czech Republic), Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic) and Renata VESELSKÁ (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Neoplasma, 2007, 0028-2685

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 1.208

RIV identification code

RIV/00216224:14310/07:00022094

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000246073600006

Keywords in English

glioblastoma multiforme; molecular cytogenetics; FISH; array-CGH

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 24/5/2007 15:41, prof. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.

Abstract

V originále

Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common as well as the most aggressive type of adult primary brain tumor of astrocytic origin. GBM is characterized by a high degree of intratumoral heterogeneity both in histomorphology and genetic changes. Nevertheless, trisomy/polysomy of chromosome 7, monosomy of chromosome 10, EGFR gene amplification and p53 deletion have been described as the typical genetic markers for tumor classification and prediction of possible response to therapy. Our work was based on detection of these four main genetic changes both in central and peripheral parts of the tumors to evaluate possible differences in the topological incidence of these genetic markers. Chromosomal abnormalities in tumor samples from a group of 21 patients surgically treated for GBM were characterized by means of the interphase-fluorescence in situ hybridization (I-FISH) technique using sets of centromere and locus-specific DNA probes. In addition, we performed a detailed analysis of one selected tumor sample using a genomic microarray system (GenoSensor Array 300) to characterize copy number changes of specific sequences and refine results obtained by I-FISH. However, the data show no significant differences in occurrence of the described genetic markers in either part of the tumors.

In Czech

Multiformní glioblastom (glioblastoma multiforme, GBM) je nejčastější a současně nejagresivnější typ primárních nádorů mozku astrocytického původu u dospělých. GBM je charakterizován vysokým stupněm heterogenity nádoru, která se týká histomorfologie i genetických změn. Typickými genetickými změnami u GBM, které mají klasifikační a případně i prognostický význam, jsou trisomie / polysomie chromosomu 7, monosomie chromosomu 10, amplifikace genu EGFR a delece genu p53. Naše práce byla založena na detekci těchto čtyř hlavních genetických abnormalit současně v centrálních a periferních částech jednotlivých nádorů s cílem detekovat případné rozdíly v topologické incidenci těchto genetických markerů. Detekce těchto genetických změn byla provedena ve vzorcích nádorové tkáně celkem 21 pacientů s diagnózou GBM metodou interfázní fluorescenční in situ hybridizace (I-FISH) s využitím centromerických a lokus-specifických DNA sond. U jednoho vybraného vzorku byla navíc provedena detailní analýza s využitím systému pro CGH-arrays, jejímž cílem bylo detekovat změny počtu kopií vybraných genových sekvencí a zpřesnit tak výsledky dosažené pomocí I-FISH. Získané výsledky nicméně nepotvrdily významné rozdíly ve výskytu uvedených genetických markerů v odlišných částech nádoru.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
OC B19.001, research and development project
Name: Genová diagnostika a terapie multiformního glioblastomu (Acronym: COST)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Gene Diagnostics and Therapy of Multiform Glioblastoma